More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3616 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 273 aa  553  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.824236  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65 
 
 		 287 aa  319  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0920178 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.3 
 
 		 267 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0435882  hitchhiker  0.0000139106 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.37 
 
 		 267 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.15 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.06102  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.85 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.51 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.35 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7160  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.16 
 
 		 262 aa  231  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0940  putative short-chain dehydrogenase  44.66 
 
 		 266 aa  225  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1935  putative short-chain alcohol dehydrogenase  46.33 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000230306  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.24 
 
 		 266 aa  208  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 		 273 aa  205  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0972  putative short-chain dehydrogenase/reductase  44.79 
 
 		 268 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000126906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5379  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.92 
 
 		 269 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.122542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.79 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269843 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0968  putative short-chain dehydrogenase/reductase  42.97 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.79 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365556  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.05 
 
 		 277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  38.37 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  38.22 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0477123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 250 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  37.84 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  37.84 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  37.84 
 
 		 269 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  37.84 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  37.84 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 272 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  37.84 
 
 		 259 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.16 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  39.62 
 
 		 269 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 		 282 aa  153  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4142  short chain dehydrogenase  35 
 
 		 272 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3412  short chain dehydrogenase  37.21 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0947163  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0137  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0620  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0588  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 		 260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194347  normal  0.0391008 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.7 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.43 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.78 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 		 252 aa  149  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  38.31 
 
 		 269 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.88 
 
 		 253 aa  149  6e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  37.93 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933062  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699646  normal  0.368322 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10933  conserved hypothetical protein  34.85 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.08 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 		 246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.63 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 		 256 aa  145  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 		 280 aa  145  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.68 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 		 259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  33.46 
 
 		 257 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5156  short chain dehydrogenase  37.26 
 
 		 254 aa  145  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0545  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.074184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2765  short chain dehydrogenase  35.93 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.77 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3955  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.68 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.63 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.19 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.5 
 
 		 248 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.679351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11085  conserved hypothetical protein  35.74 
 
 		 271 aa  142  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 		 248 aa  142  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3838  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.72 
 
 		 272 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0844914  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0521  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 		 260 aa  141  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847891  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1601  short chain dehydrogenase  36.88 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.786043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4665  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>