229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1767 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  98.91 
 
 
366 aa  738    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 
366 aa  743    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  98.36 
 
 
366 aa  731    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  95.9 
 
 
366 aa  719    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  98.36 
 
 
366 aa  731    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  94.54 
 
 
366 aa  693    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  95.36 
 
 
366 aa  716    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  84.17 
 
 
362 aa  634    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  84.17 
 
 
362 aa  634    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  84.44 
 
 
362 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  84.44 
 
 
362 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  84.72 
 
 
362 aa  622  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  84.44 
 
 
362 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  84.17 
 
 
362 aa  620  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  81.13 
 
 
362 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  80.59 
 
 
362 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  61.11 
 
 
368 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  60.82 
 
 
368 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  57.54 
 
 
369 aa  418  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  58.84 
 
 
365 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  56.29 
 
 
362 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  54.68 
 
 
362 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  54.97 
 
 
354 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  54.97 
 
 
362 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  44.96 
 
 
403 aa  334  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  43.3 
 
 
371 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  43.53 
 
 
380 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  41.9 
 
 
401 aa  315  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  43.25 
 
 
380 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  44.11 
 
 
368 aa  312  6.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2402  hypothetical protein  44.1 
 
 
365 aa  291  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6139  extracellular solute-binding protein  42.9 
 
 
354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160536  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6109  ABC transporter substrate binding protein (iron)  36.94 
 
 
374 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4258  putative iron ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  40.44 
 
 
366 aa  262  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289237  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2764  extracellular solute-binding protein family 1  42.42 
 
 
362 aa  259  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247835  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3338  putative iron ABC transporter, substrate-binding protein  38.87 
 
 
354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3637  extracellular solute-binding protein family 1  38.24 
 
 
348 aa  252  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276394  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0309  periplasmic iron-binding protein  36.01 
 
 
365 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1449  extracellular solute-binding protein  37.81 
 
 
364 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381136  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3357  extracellular solute-binding protein family 1  38.58 
 
 
351 aa  236  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.825817  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2272  hypothetical protein  38.01 
 
 
381 aa  235  8e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02405  periplasmic iron-binding protein  37.16 
 
 
344 aa  228  9e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0729  extracellular solute-binding protein  35.58 
 
 
363 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.706674  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0259  extracellular solute-binding protein  34.63 
 
 
346 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0288  periplasmic iron-binding protein  33.63 
 
 
346 aa  212  9e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4430  periplasmic iron-binding protein  35.17 
 
 
350 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0059  extracellular solute-binding protein family 1  33.97 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4161  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  31.37 
 
 
369 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648243  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0059  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 
377 aa  182  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2735  putative iron(III) transport system substrate-binding protein  33.75 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0641317  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1804  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  31.25 
 
 
354 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3126  putative periplasmic iron-binding protein  32.61 
 
 
333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3493  extracellular solute-binding protein  33.03 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685703  normal  0.0583739 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  31.19 
 
 
374 aa  152  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  31.67 
 
 
364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2265  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 
380 aa  143  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4733  putative periplasmic solute-binding protein  39.74 
 
 
155 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1842  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 
332 aa  90.5  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0219325  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 
338 aa  88.6  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 
333 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  26.92 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  26.62 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  27.55 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1735  ABC transporter substrate-binding protein  27.55 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.62 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1572  ABC transporter, substrate-binding protein  27.55 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1786  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.55 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.62 
 
 
341 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.28 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.19 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.6 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0009  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.892782  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  24.92 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
350 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0120  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21960  hypothetical protein  26.98 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000202681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  24.7 
 
 
344 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2833  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 
320 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1875  hypothetical protein  26.58 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1309  putative transporter  22.59 
 
 
337 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442575  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 
342 aa  64.3  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 
326 aa  64.3  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 
322 aa  62.8  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 
366 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 
343 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0440  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.09 
 
 
350 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.576038  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0641  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  23.41 
 
 
343 aa  61.2  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147653  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 
328 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>