131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0161 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
368 aa  728    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  45.21 
 
 
362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  42.98 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.53 
 
 
362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.53 
 
 
362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  42.98 
 
 
366 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  46.53 
 
 
362 aa  325  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.53 
 
 
362 aa  323  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  45.02 
 
 
366 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.53 
 
 
362 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  46.53 
 
 
362 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  46.53 
 
 
362 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  42.7 
 
 
366 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  42.7 
 
 
366 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  46.53 
 
 
362 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  42.7 
 
 
366 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  44.11 
 
 
366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  43.53 
 
 
369 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  43.54 
 
 
362 aa  308  6.999999999999999e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  47.84 
 
 
371 aa  308  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  43.26 
 
 
362 aa  308  8e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.26 
 
 
354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  48.94 
 
 
403 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  43.47 
 
 
362 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  48.75 
 
 
401 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  43.67 
 
 
365 aa  294  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  42.47 
 
 
368 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  42.33 
 
 
368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  46.95 
 
 
380 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  46.65 
 
 
380 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2402  hypothetical protein  46.7 
 
 
365 aa  276  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6139  extracellular solute-binding protein  47.19 
 
 
354 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160536  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2764  extracellular solute-binding protein family 1  46.74 
 
 
362 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247835  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02405  periplasmic iron-binding protein  45.64 
 
 
344 aa  258  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3357  extracellular solute-binding protein family 1  45.34 
 
 
351 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.825817  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0309  periplasmic iron-binding protein  39.83 
 
 
365 aa  242  7.999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0259  extracellular solute-binding protein  42.47 
 
 
346 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2272  hypothetical protein  43.08 
 
 
381 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0288  periplasmic iron-binding protein  42.64 
 
 
346 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6109  ABC transporter substrate binding protein (iron)  37.58 
 
 
374 aa  236  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3338  putative iron ABC transporter, substrate-binding protein  38.89 
 
 
354 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3637  extracellular solute-binding protein family 1  38.58 
 
 
348 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276394  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4258  putative iron ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  36.22 
 
 
366 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289237  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4430  periplasmic iron-binding protein  36.5 
 
 
350 aa  219  7.999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0059  extracellular solute-binding protein  42.33 
 
 
377 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1804  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  33.99 
 
 
354 aa  203  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0729  extracellular solute-binding protein  37.89 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.706674  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0059  extracellular solute-binding protein family 1  38.78 
 
 
370 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2735  putative iron(III) transport system substrate-binding protein  40.25 
 
 
303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0641317  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3493  extracellular solute-binding protein  40.13 
 
 
358 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685703  normal  0.0583739 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1449  extracellular solute-binding protein  37.46 
 
 
364 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381136  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3126  putative periplasmic iron-binding protein  36.44 
 
 
333 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4161  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  32.1 
 
 
369 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648243  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  30.25 
 
 
364 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2265  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 
380 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4733  putative periplasmic solute-binding protein  42.58 
 
 
155 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 
374 aa  105  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.6 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.6 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  25.18 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.28 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.09 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 
341 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1572  ABC transporter, substrate-binding protein  24.6 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1786  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.6 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1201  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 
320 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.523727 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  24.28 
 
 
341 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1735  ABC transporter substrate-binding protein  24.28 
 
 
341 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4911  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 
326 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
338 aa  58.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3418  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 
354 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  21.16 
 
 
364 aa  57.4  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1588  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 
368 aa  57  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1471  extracellular solute-binding protein family 1  27.45 
 
 
359 aa  55.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1842  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0219325  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0041  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 
336 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1309  putative transporter  25 
 
 
337 aa  54.3  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442575  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 
350 aa  52.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1875  hypothetical protein  26.93 
 
 
352 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1726  ABC transporter, periplasmic binding protein  27.58 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477367  normal  0.0250834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3993  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  27.91 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.249752  normal  0.268451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1318  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
352 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.801159  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 
342 aa  50.8  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1501  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 
348 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 
326 aa  50.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  22.39 
 
 
343 aa  49.7  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6061  extracellular solute-binding protein family 1  21.49 
 
 
342 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1686  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.07 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224605  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0725  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 
350 aa  49.3  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1116  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
361 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2481  extracellular solute-binding protein family 1  22.34 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.37214  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21960  hypothetical protein  25.48 
 
 
352 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000202681 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1215  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.74 
 
 
353 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0399502  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0652  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.74 
 
 
353 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1412  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.74 
 
 
353 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0501  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.74 
 
 
353 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>