89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1449 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1449  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
364 aa  731    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381136  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0729  extracellular solute-binding protein  46.39 
 
 
363 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.706674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  41.18 
 
 
401 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  37.81 
 
 
366 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 
366 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  37.81 
 
 
366 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 
366 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  37.81 
 
 
366 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 
366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  39.32 
 
 
371 aa  232  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  36.88 
 
 
366 aa  229  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.56 
 
 
362 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.56 
 
 
362 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6109  ABC transporter substrate binding protein (iron)  33.99 
 
 
374 aa  226  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2402  hypothetical protein  37.22 
 
 
365 aa  225  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3338  putative iron ABC transporter, substrate-binding protein  32.77 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  36.25 
 
 
362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  36.25 
 
 
362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.25 
 
 
362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  36.39 
 
 
362 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  35.31 
 
 
362 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  35.62 
 
 
362 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.62 
 
 
362 aa  219  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0309  periplasmic iron-binding protein  35.29 
 
 
365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3637  extracellular solute-binding protein family 1  34.45 
 
 
348 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276394  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4258  putative iron ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  33.86 
 
 
366 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289237  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  33.52 
 
 
369 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  35.99 
 
 
403 aa  209  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3357  extracellular solute-binding protein family 1  39.26 
 
 
351 aa  207  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.825817  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  33.65 
 
 
368 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  33.65 
 
 
368 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  37.58 
 
 
380 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  33.01 
 
 
365 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02405  periplasmic iron-binding protein  37.84 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  37.26 
 
 
380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  33.01 
 
 
362 aa  199  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.01 
 
 
354 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  32.69 
 
 
362 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6139  extracellular solute-binding protein  37.85 
 
 
354 aa  199  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160536  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0059  extracellular solute-binding protein family 1  37.98 
 
 
370 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  32.69 
 
 
362 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0059  extracellular solute-binding protein  38.19 
 
 
377 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2272  hypothetical protein  37.22 
 
 
381 aa  192  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  37.46 
 
 
368 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4430  periplasmic iron-binding protein  33.75 
 
 
350 aa  189  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4161  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  31.78 
 
 
369 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648243  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2764  extracellular solute-binding protein family 1  38.94 
 
 
362 aa  186  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247835  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0259  extracellular solute-binding protein  35.4 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0288  periplasmic iron-binding protein  35.1 
 
 
346 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1804  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  32.91 
 
 
354 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3126  putative periplasmic iron-binding protein  35.37 
 
 
333 aa  156  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3493  extracellular solute-binding protein  33.96 
 
 
358 aa  155  9e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685703  normal  0.0583739 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2735  putative iron(III) transport system substrate-binding protein  32.28 
 
 
303 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0641317  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2265  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 
380 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4733  putative periplasmic solute-binding protein  36.24 
 
 
155 aa  87  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  25.19 
 
 
364 aa  72.8  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1588  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 
368 aa  59.3  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3951  extracellular solute-binding protein  38.37 
 
 
366 aa  53.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0469175  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
363 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4911  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1554  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
354 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.202841  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  22.84 
 
 
333 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  21.75 
 
 
341 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  21.68 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 
341 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.52 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3418  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  22.52 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2948  ABC transporter substrate binding protein  34.25 
 
 
366 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.52 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0924  extracellular solute-binding protein family 1  20 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2917  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 
339 aa  47  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1545  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 
339 aa  47  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.061269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0829  extracellular solute-binding protein  38.98 
 
 
368 aa  46.2  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 
333 aa  46.2  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0346  ABC transporter, substrate binding protein  40.68 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1990  extracellular solute-binding protein  40.68 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0950  extracellular solute-binding protein  40.68 
 
 
366 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
338 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2471  extracellular solute-binding protein  36.07 
 
 
390 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  24.63 
 
 
272 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2152  putative periplasmic solute-binding protein  35.29 
 
 
342 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.123138 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 
343 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  25 
 
 
364 aa  43.5  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4354  putative ABC transport system, substrate-binding exported protein  23.82 
 
 
359 aa  43.5  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4201  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.94 
 
 
371 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476825 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  21.6 
 
 
350 aa  42.7  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5430  putative lipoprotein  29.1 
 
 
344 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>