86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2272 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2272  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  783    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2764  extracellular solute-binding protein family 1  46.03 
 
 		 362 aa  294  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6139  extracellular solute-binding protein  44.48 
 
 		 354 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  40.24 
 
 		 401 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  38.34 
 
 		 362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  42.95 
 
 		 403 aa  242  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.56 
 
 		 362 aa  242  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  43.08 
 
 		 368 aa  242  9e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.56 
 
 		 362 aa  242  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  38.01 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  38.71 
 
 		 371 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  37.69 
 
 		 366 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  37.69 
 
 		 366 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  37.69 
 
 		 366 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  39.56 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.56 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  39.56 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  39.56 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  37.07 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  37.07 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  38.01 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.39 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6109  ABC transporter substrate binding protein (iron)  35.54 
 
 		 374 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  37.23 
 
 		 362 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  41.69 
 
 		 380 aa  229  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  41.69 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4258  putative iron ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  36.56 
 
 		 366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3637  extracellular solute-binding protein family 1  37.16 
 
 		 348 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3338  putative iron ABC transporter, substrate-binding protein  36.86 
 
 		 354 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4430  periplasmic iron-binding protein  38.24 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02405  periplasmic iron-binding protein  40.06 
 
 		 344 aa  217  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3357  extracellular solute-binding protein family 1  38.61 
 
 		 351 aa  216  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.825817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  33.75 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.75 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2402  hypothetical protein  35.44 
 
 		 365 aa  202  8e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  33.44 
 
 		 362 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0259  extracellular solute-binding protein  37.06 
 
 		 346 aa  199  7.999999999999999e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  35.31 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1449  extracellular solute-binding protein  37.22 
 
 		 364 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381136  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0288  periplasmic iron-binding protein  36.86 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0729  extracellular solute-binding protein  37.85 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.706674  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0059  extracellular solute-binding protein  36.99 
 
 		 377 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1804  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  34.27 
 
 		 354 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  33.44 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0059  extracellular solute-binding protein family 1  34.8 
 
 		 370 aa  189  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0309  periplasmic iron-binding protein  35.69 
 
 		 365 aa  189  9e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  33.12 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3493  extracellular solute-binding protein  36.53 
 
 		 358 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685703  normal  0.0583739 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3126  putative periplasmic iron-binding protein  34.29 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4161  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  30.5 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2735  putative iron(III) transport system substrate-binding protein  32.69 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0641317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2265  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 380 aa  96.7  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4733  putative periplasmic solute-binding protein  32.65 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  25.65 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 333 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  21.72 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 336 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 350 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5430  putative lipoprotein  24.28 
 
 		 344 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5376  putative lipoprotein  22.96 
 
 		 344 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2940  twin-arginine translocation pathway signal  24.43 
 
 		 366 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5350  putative lipoprotein  23.7 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4956  ABC transporter substrate-binding protein  24.28 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21350  ABC-type Fe3+ transport system, substrate binding component  25.95 
 
 		 349 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5501  putative lipoprotein  23.7 
 
 		 344 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5110  putative lipoprotein  23.7 
 
 		 344 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4941  ABC transporter substrate-binding protein  23.7 
 
 		 344 aa  47  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4658  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 440 aa  46.6  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  25.71 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 343 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6060  extracellular solute-binding protein family 1  20.22 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5382  putative lipoprotein  23.43 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5572  putative lipoprotein  23.43 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0223  hypothetical protein  26.62 
 
 		 339 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3145  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.47265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0643  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  23.33 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121089  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0223  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.62 
 
 		 339 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  21.77 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1842  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0219325  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 382 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  24.21 
 
 		 337 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 337 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>