175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6139 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6139  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 354 aa  704    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2764  extracellular solute-binding protein family 1  80 
 
 		 362 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247835  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  42.9 
 
 		 366 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  42.9 
 
 		 366 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  44.14 
 
 		 362 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  44.92 
 
 		 362 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.37 
 
 		 362 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.37 
 
 		 362 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  42.34 
 
 		 366 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  42.34 
 
 		 366 aa  281  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  42.9 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  42.9 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  46.44 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2272  hypothetical protein  44.48 
 
 		 381 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.37 
 
 		 362 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  43.37 
 
 		 362 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  43.37 
 
 		 362 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  43.37 
 
 		 362 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.86 
 
 		 362 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  41.5 
 
 		 366 aa  269  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  46.25 
 
 		 368 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  45 
 
 		 403 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  43.92 
 
 		 401 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  43.34 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  44.69 
 
 		 380 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  41.98 
 
 		 368 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  44.38 
 
 		 380 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  37.18 
 
 		 362 aa  256  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  36.9 
 
 		 362 aa  256  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  41.41 
 
 		 368 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  39.52 
 
 		 371 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.67 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2402  hypothetical protein  40.19 
 
 		 365 aa  236  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6109  ABC transporter substrate binding protein (iron)  36.28 
 
 		 374 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0309  periplasmic iron-binding protein  37.27 
 
 		 365 aa  225  9e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4258  putative iron ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  36.28 
 
 		 366 aa  222  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3338  putative iron ABC transporter, substrate-binding protein  36.25 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3637  extracellular solute-binding protein family 1  36.59 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4430  periplasmic iron-binding protein  34.76 
 
 		 350 aa  205  8e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02405  periplasmic iron-binding protein  41.27 
 
 		 344 aa  203  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1449  extracellular solute-binding protein  38.49 
 
 		 364 aa  203  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381136  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0288  periplasmic iron-binding protein  39.1 
 
 		 346 aa  199  7e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3357  extracellular solute-binding protein family 1  38.41 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.825817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0259  extracellular solute-binding protein  38.14 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1804  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  33.44 
 
 		 354 aa  186  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3126  putative periplasmic iron-binding protein  37.18 
 
 		 333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0729  extracellular solute-binding protein  36.19 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.706674  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4161  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  32.81 
 
 		 369 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0059  extracellular solute-binding protein  36.88 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0059  extracellular solute-binding protein family 1  36 
 
 		 370 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3493  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685703  normal  0.0583739 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2735  putative iron(III) transport system substrate-binding protein  35.48 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0641317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  31.7 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2265  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 374 aa  109  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4733  putative periplasmic solute-binding protein  36.55 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2833  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 320 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2736  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 		 325 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288744  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  26.42 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1572  ABC transporter, substrate-binding protein  26.42 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1735  ABC transporter substrate-binding protein  26.42 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1786  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.42 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  25.91 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.91 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.91 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.91 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2481  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.37214  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.91 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21350  ABC-type Fe3+ transport system, substrate binding component  28.25 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  26.35 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 325 aa  53.9  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1588  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 368 aa  53.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 342 aa  53.9  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  24.48 
 
 		 344 aa  53.5  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1842  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 332 aa  52.8  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0219325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0120  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2948  ABC transporter substrate binding protein  23.73 
 
 		 366 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1208  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 342 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.527758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2074  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1791  solute-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.86 
 
 		 343 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  0.0698003 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1116  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 361 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1762  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 340 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66245  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4456  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 337 aa  50.4  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00193533  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 350 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1080  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 377 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0294396  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3891  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 327 aa  49.7  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 382 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1237  extracellular metal-binding protein  23.95 
 
 		 358 aa  49.7  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1117  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 361 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>