190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1080 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1080  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
377 aa  760    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0294396  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5742  extracellular solute-binding protein  87.77 
 
 
383 aa  676    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5127  extracellular solute-binding protein  78.82 
 
 
375 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5216  extracellular solute-binding protein  78.82 
 
 
375 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5507  extracellular solute-binding protein  78.55 
 
 
375 aa  595  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2054  extracellular solute-binding protein  64.23 
 
 
378 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7381  extracellular solute-binding protein  56.69 
 
 
387 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1111  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  45.87 
 
 
388 aa  334  2e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3334  extracellular solute-binding protein  51.64 
 
 
385 aa  318  7e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1380  ABC polyamine/opine/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  44.78 
 
 
382 aa  299  6e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3029  extracellular solute-binding protein family 1  48.82 
 
 
360 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.710769  normal  0.124039 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3326  Integrase catalytic region  49.24 
 
 
356 aa  292  8e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.138399  normal  0.815514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2471  extracellular solute-binding protein  41.76 
 
 
390 aa  269  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1234  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  46.33 
 
 
414 aa  269  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0984  extracellular solute-binding protein  48.33 
 
 
366 aa  268  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.366377  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0793  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  45.88 
 
 
410 aa  264  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.295736  normal  0.158194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8437  extracellular solute-binding protein  44.2 
 
 
349 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4228  extracellular solute-binding protein  41.14 
 
 
367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0105  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.32 
 
 
367 aa  231  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0115  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.02 
 
 
367 aa  230  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512733  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0514  extracellular solute-binding protein family 1  39.05 
 
 
371 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.843064  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4201  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.99 
 
 
371 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0221  extracellular solute-binding protein  39.4 
 
 
365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1990  extracellular solute-binding protein  42.22 
 
 
366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0500  extracellular solute-binding protein  39.4 
 
 
367 aa  220  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2637  extracellular solute-binding protein family 1  40.42 
 
 
367 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142963  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2897  extracellular solute-binding protein family 1  40.12 
 
 
367 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2134  extracellular solute-binding protein  40.3 
 
 
364 aa  218  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.575498  normal  0.605089 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0346  ABC transporter, substrate binding protein  41.62 
 
 
366 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1434  ABC transporter solute-binding protein  40.76 
 
 
378 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0950  extracellular solute-binding protein  41.02 
 
 
366 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2948  ABC transporter substrate binding protein  39.22 
 
 
366 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0829  extracellular solute-binding protein  39.57 
 
 
368 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1875  hypothetical protein  31.79 
 
 
352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21960  hypothetical protein  31.72 
 
 
352 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000202681 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4488  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
353 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.627866 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0827  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.12 
 
 
348 aa  143  6e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.31 
 
 
348 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.860784  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1318  extracellular solute-binding protein  32.87 
 
 
352 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.801159  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1726  ABC transporter, periplasmic binding protein  32.52 
 
 
354 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477367  normal  0.0250834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3993  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  32.52 
 
 
354 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.249752  normal  0.268451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1686  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.27 
 
 
354 aa  139  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224605  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0725  extracellular solute-binding protein family 1  33.22 
 
 
350 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0746  extracellular solute-binding protein family 1  32.88 
 
 
350 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1275  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 
354 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828972  normal  0.567692 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000661  putative periplasmic solute-binding protein  31.4 
 
 
355 aa  136  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  32.75 
 
 
362 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  33.21 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3071  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.91 
 
 
353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4343  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  35.16 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1501  extracellular solute-binding protein  32.79 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1116  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 
361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1215  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.91 
 
 
353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0399502  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0652  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.91 
 
 
353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1412  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.91 
 
 
353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1419  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.91 
 
 
353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0501  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.91 
 
 
353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1208  extracellular solute-binding protein  34.56 
 
 
342 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.527758  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1606  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.53 
 
 
355 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.273588 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0753  extracellular solute-binding protein  34.56 
 
 
365 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1234  extracellular solute-binding protein  34.56 
 
 
365 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2152  putative periplasmic solute-binding protein  31.53 
 
 
342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.123138 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1471  extracellular solute-binding protein family 1  33.45 
 
 
359 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1027  hypothetical protein  30.63 
 
 
355 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.45 
 
 
844 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1117  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 
361 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.44 
 
 
362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.34313  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1786  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.44 
 
 
362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0818  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.44 
 
 
362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0448  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.44 
 
 
362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3878  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.83 
 
 
355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1459  extracellular solute-binding protein family 1  34.91 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0283759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2074  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.44 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0354  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.44 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2082  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.44 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1418  extracellular solute-binding protein family 1  34.18 
 
 
343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.58033  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2829  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.33 
 
 
353 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3418  extracellular solute-binding protein family 1  31.18 
 
 
354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1332  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  31.33 
 
 
352 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0623244  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1791  solute-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  33.45 
 
 
343 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  0.0698003 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5374  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.29 
 
 
362 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0583866  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5486  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.29 
 
 
362 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4569  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4785  extracellular solute-binding protein  32.29 
 
 
363 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1913  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 
348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0831866  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3454  putative periplasmic solute-binding protein  30.26 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357351  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1265  extracellular solute-binding protein family 1  30.37 
 
 
337 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11396  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3124  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 
345 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4695  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 
333 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4840  putative ABC transporter periplasmic binding component  30.86 
 
 
340 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0305994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0486  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.34 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.64062  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4354  putative ABC transport system, substrate-binding exported protein  29.19 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1273  putative periplasmic solute-binding protein  26.95 
 
 
333 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384428  normal  0.646198 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3312  putative periplasmic solute-binding protein  28.57 
 
 
339 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00706911  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1663  extracellular solute-binding protein family 1  32.82 
 
 
335 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4046  putative periplasmic solute-binding protein  27.31 
 
 
335 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0699034  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5854  hypothetical protein  25.56 
 
 
335 aa  96.3  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5734  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.21 
 
 
381 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.909966  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2372  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1945  iron ABC transporter, iron-binding protein  25.27 
 
 
345 aa  63.5  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>