63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3338 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3338  putative iron ABC transporter, substrate-binding protein  100 
 
 
354 aa  723    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3637  extracellular solute-binding protein family 1  95.98 
 
 
348 aa  685    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276394  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4258  putative iron ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  86.89 
 
 
366 aa  595  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289237  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6109  ABC transporter substrate binding protein (iron)  81.61 
 
 
374 aa  583  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0309  periplasmic iron-binding protein  56.77 
 
 
365 aa  411  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  38.87 
 
 
366 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  38.87 
 
 
366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  38.56 
 
 
366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  38.87 
 
 
366 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  38.87 
 
 
366 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  38.87 
 
 
366 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  41.32 
 
 
403 aa  250  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  38.55 
 
 
362 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  38.24 
 
 
366 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  39.45 
 
 
371 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.93 
 
 
362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.93 
 
 
362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  38.77 
 
 
401 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  37.35 
 
 
362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  37.93 
 
 
362 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.93 
 
 
362 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  37.93 
 
 
362 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  37.93 
 
 
362 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  41.01 
 
 
380 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  40.69 
 
 
380 aa  235  7e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.99 
 
 
362 aa  235  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  36.44 
 
 
365 aa  230  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  35.46 
 
 
362 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  35.46 
 
 
362 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  35.14 
 
 
362 aa  227  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.14 
 
 
354 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  35.33 
 
 
369 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  38.7 
 
 
368 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  35.8 
 
 
368 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1449  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 
364 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381136  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  35.78 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2272  hypothetical protein  36.86 
 
 
381 aa  215  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0729  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 
363 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.706674  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2764  extracellular solute-binding protein family 1  39.33 
 
 
362 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6139  extracellular solute-binding protein  36.25 
 
 
354 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160536  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4430  periplasmic iron-binding protein  33.75 
 
 
350 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3357  extracellular solute-binding protein family 1  34.92 
 
 
351 aa  206  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.825817  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02405  periplasmic iron-binding protein  34.08 
 
 
344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2402  hypothetical protein  32.69 
 
 
365 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4161  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  29.56 
 
 
369 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648243  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0259  extracellular solute-binding protein  34.22 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0288  periplasmic iron-binding protein  34.22 
 
 
346 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0059  extracellular solute-binding protein family 1  35.11 
 
 
370 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3493  extracellular solute-binding protein  35.09 
 
 
358 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685703  normal  0.0583739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1804  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  31.9 
 
 
354 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3126  putative periplasmic iron-binding protein  31.03 
 
 
333 aa  170  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0059  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 
377 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2735  putative iron(III) transport system substrate-binding protein  32.19 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0641317  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4733  putative periplasmic solute-binding protein  31.72 
 
 
155 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2265  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  22.99 
 
 
364 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 
333 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 
381 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1201  extracellular solute-binding protein family 1  21.83 
 
 
320 aa  47  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.523727 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  21.61 
 
 
338 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 
382 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4911  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
333 aa  42.7  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.316622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>