More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2294 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  88.48 
 
 		 382 aa  667    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 381 aa  765    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  36.63 
 
 		 349 aa  207  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  34.13 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  32.72 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  35.45 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2890  extracellular solute-binding protein family 1  31.46 
 
 		 360 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  36.84 
 
 		 355 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  34.08 
 
 		 340 aa  169  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  32.8 
 
 		 355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  35.58 
 
 		 366 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  34.44 
 
 		 356 aa  160  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.252568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 		 340 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 		 347 aa  155  9e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  33.67 
 
 		 333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  33.66 
 
 		 335 aa  153  5e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 333 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  33 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  33 
 
 		 333 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  32.67 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  34.01 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  33.55 
 
 		 345 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  33 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  33.94 
 
 		 363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  31.87 
 
 		 346 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  34.42 
 
 		 350 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  30.56 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  34.48 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  34.09 
 
 		 350 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  32.43 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  33.11 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  33.67 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 		 372 aa  144  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  31.68 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  33.56 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  33.56 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 		 338 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  33 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  32.87 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  32.63 
 
 		 340 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  32.98 
 
 		 338 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  31.35 
 
 		 345 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  30.21 
 
 		 352 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  32.61 
 
 		 347 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  32.61 
 
 		 347 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  32.21 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  32.61 
 
 		 347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  32.61 
 
 		 347 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 		 347 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  32.3 
 
 		 347 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  33.02 
 
 		 329 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  32.2 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  31.69 
 
 		 333 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  32.2 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  32.63 
 
 		 345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  33.12 
 
 		 341 aa  132  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  33.13 
 
 		 354 aa  132  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  34.81 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  33.11 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  29.7 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  32.15 
 
 		 362 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 		 339 aa  129  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  31.8 
 
 		 345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1511  ABC transporter, substrate binding protein  31.6 
 
 		 351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  30.27 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  31.47 
 
 		 339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  34.3 
 
 		 340 aa  126  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  31.47 
 
 		 339 aa  126  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  31.6 
 
 		 347 aa  125  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  28.43 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  29.6 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  31.29 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  31.29 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  31.29 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6288  extracellular solute-binding protein  31.68 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  31.29 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4447  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 337 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  32.43 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  31.29 
 
 		 351 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  28.93 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  31.29 
 
 		 351 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>