More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4112 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  95 
 
 		 340 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 338 aa  686    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  75.38 
 
 		 329 aa  532  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  63.74 
 
 		 352 aa  456  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  68.95 
 
 		 351 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  62.57 
 
 		 338 aa  441  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  64.84 
 
 		 338 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  63.88 
 
 		 338 aa  441  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  62.46 
 
 		 338 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  62.76 
 
 		 338 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  67.1 
 
 		 337 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  61.29 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  61 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  61 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  59.94 
 
 		 342 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  59.94 
 
 		 342 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  59.94 
 
 		 342 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  60.36 
 
 		 341 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5750  extracellular solute-binding protein  60.76 
 
 		 341 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177697  normal  0.666773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  55.26 
 
 		 358 aa  381  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  55.66 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  51.62 
 
 		 343 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  51.62 
 
 		 333 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  44.69 
 
 		 335 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  44.69 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  39.7 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  39.22 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  37.65 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  37.65 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  41.1 
 
 		 336 aa  227  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4671  extracellular solute-binding protein  38.77 
 
 		 337 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164274  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  38.04 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  38.31 
 
 		 343 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  36.09 
 
 		 340 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  32.47 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  32.9 
 
 		 372 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  33.73 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 379 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  34.76 
 
 		 342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  33.01 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  34.5 
 
 		 363 aa  186  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  34.87 
 
 		 356 aa  185  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.252568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  34.74 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  34.23 
 
 		 345 aa  176  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  31.37 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  35.33 
 
 		 340 aa  153  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2720  extracellular solute-binding protein family 1  31.62 
 
 		 353 aa  149  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.015536  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  32.38 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  32.23 
 
 		 365 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  32.23 
 
 		 365 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 		 381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  32.79 
 
 		 382 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 		 347 aa  136  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  32.55 
 
 		 347 aa  135  8e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  32.63 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  30.77 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 		 349 aa  126  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  26.81 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 350 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  30.09 
 
 		 349 aa  123  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2890  extracellular solute-binding protein family 1  30.88 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2002  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  28.92 
 
 		 332 aa  122  9e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20451  hypothetical protein  30.54 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 346 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1578  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  28.61 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.49279  normal  0.0225547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0162  ABC-type iron(III) transport system,substrate-binding protein  26.95 
 
 		 385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 		 337 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  28.72 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  27.68 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  29.59 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  29.05 
 
 		 334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 351 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  29.04 
 
 		 353 aa  116  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 333 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  27.18 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  30.47 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12551  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  29.38 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.733876  hitchhiker  0.00360834 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  29.64 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  28.72 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  26.61 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 334 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 374 aa  113  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 333 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 347 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  30.07 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  27.54 
 
 		 326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  31.47 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>