More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7421 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 348 aa  695    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  46.9 
 
 		 347 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  48.54 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  45.09 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  39.94 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  39.42 
 
 		 340 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  40.88 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  38.84 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  40.91 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  41.1 
 
 		 343 aa  246  6e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  39.81 
 
 		 338 aa  245  9e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  41.5 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  42.61 
 
 		 329 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  39.24 
 
 		 338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  40.44 
 
 		 339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  40.94 
 
 		 339 aa  239  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  40.94 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  38.49 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 		 341 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  39.31 
 
 		 358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  37.12 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  35.69 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5750  extracellular solute-binding protein  38.24 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177697  normal  0.666773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  38.76 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  38.76 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  38.85 
 
 		 351 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  39.17 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  37.98 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  38.51 
 
 		 342 aa  219  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  40.89 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  41.13 
 
 		 336 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  36.73 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  36.73 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  36.52 
 
 		 337 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  37.07 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 		 355 aa  203  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  35.4 
 
 		 340 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  36.94 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4671  extracellular solute-binding protein  37.59 
 
 		 337 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164274  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  35.59 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.252568 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  33.97 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  34.62 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2720  extracellular solute-binding protein family 1  35.43 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.015536  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  36.62 
 
 		 328 aa  171  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  32.64 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  31.27 
 
 		 346 aa  139  7.999999999999999e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  31.42 
 
 		 347 aa  139  8.999999999999999e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  31.46 
 
 		 374 aa  138  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  31.46 
 
 		 374 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  29.61 
 
 		 365 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  29.61 
 
 		 365 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  33.78 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  30.72 
 
 		 366 aa  130  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  31.82 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  31.69 
 
 		 335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  31.82 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  33.44 
 
 		 340 aa  126  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  29.67 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0162  ABC-type iron(III) transport system,substrate-binding protein  31.72 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 		 381 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  28.57 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  28.57 
 
 		 334 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  30.28 
 
 		 349 aa  119  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4447  extracellular solute-binding protein  34.28 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 372 aa  117  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  32.12 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1876  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  32.12 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00162  putative ABC-type transport system, periplasmic component  30.79 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2277  extracellular solute-binding protein family 1  29.75 
 
 		 397 aa  112  8.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0440  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.14 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.576038  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  29.66 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  31.89 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  31.79 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 		 345 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  29.14 
 
 		 347 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  29.68 
 
 		 333 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  29.27 
 
 		 349 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2002  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  27.81 
 
 		 332 aa  109  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  28.93 
 
 		 348 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  31.71 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.6 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  28.73 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  31.01 
 
 		 354 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>