More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4828 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 347 aa  700    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  93.95 
 
 		 343 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  78.43 
 
 		 344 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  46.9 
 
 		 348 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  43.17 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  44.61 
 
 		 335 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  44.59 
 
 		 335 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  41.41 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  40.62 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  40.12 
 
 		 341 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  40.62 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  40.62 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  43 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5750  extracellular solute-binding protein  40.32 
 
 		 341 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177697  normal  0.666773 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  40.18 
 
 		 339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  39.88 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  39.58 
 
 		 339 aa  242  5e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  38.76 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  40.84 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  38.76 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  39.05 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  40.45 
 
 		 337 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  39.94 
 
 		 352 aa  236  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  39.62 
 
 		 338 aa  236  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  39.47 
 
 		 338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  38.66 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4671  extracellular solute-binding protein  39.23 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164274  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  38.96 
 
 		 338 aa  232  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  38.27 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  38.18 
 
 		 338 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  39.23 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  37.46 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  38.34 
 
 		 338 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  37.82 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  39.29 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  35.69 
 
 		 349 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  35.67 
 
 		 342 aa  203  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  33.96 
 
 		 355 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  35.58 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  33.87 
 
 		 340 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  34.73 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  34.73 
 
 		 345 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  34.52 
 
 		 366 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  34.38 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  35.56 
 
 		 356 aa  169  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.252568 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  34.36 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  31.66 
 
 		 374 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  31.97 
 
 		 374 aa  162  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2720  extracellular solute-binding protein family 1  33.73 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.015536  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  32.46 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  32.7 
 
 		 365 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  32.7 
 
 		 365 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  33.14 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 		 347 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  31.98 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  32.94 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  30.72 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  31.19 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  30.03 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  31.21 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  31 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 372 aa  142  7e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  34.67 
 
 		 351 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  34.67 
 
 		 351 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1511  ABC transporter, substrate binding protein  34.98 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  33.44 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  30.28 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  34.67 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  34.67 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  34.67 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  34.67 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  30.31 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  32.63 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  30.09 
 
 		 337 aa  139  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  31.44 
 
 		 337 aa  139  8.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  34.37 
 
 		 347 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  32.19 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  32.06 
 
 		 338 aa  138  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 		 347 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  30.91 
 
 		 352 aa  136  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00162  putative ABC-type transport system, periplasmic component  31.55 
 
 		 344 aa  136  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  31.13 
 
 		 336 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  33.95 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  33.84 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  31.33 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  33.96 
 
 		 347 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0162  ABC-type iron(III) transport system,substrate-binding protein  30.32 
 
 		 385 aa  133  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 		 347 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 		 347 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20451  hypothetical protein  29.74 
 
 		 342 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  31.04 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  30.92 
 
 		 380 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1261  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  29.57 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  30.75 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>