More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0005 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  100 
 
 		 335 aa  687    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  54.29 
 
 		 341 aa  347  1e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  50.62 
 
 		 347 aa  346  3e-94  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  51.59 
 
 		 346 aa  343  2e-93  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  50.16 
 
 		 349 aa  316  4e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  44.64 
 
 		 353 aa  305  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  45.86 
 
 		 365 aa  301  9e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  45.86 
 
 		 365 aa  301  9e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  45.99 
 
 		 355 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  43.31 
 
 		 341 aa  290  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  44.94 
 
 		 335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  43.63 
 
 		 350 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  43.31 
 
 		 350 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  44.94 
 
 		 355 aa  278  7e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  43.93 
 
 		 337 aa  276  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  43.03 
 
 		 348 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  43.35 
 
 		 347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  42.9 
 
 		 340 aa  271  8.000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  41.14 
 
 		 345 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  44.79 
 
 		 352 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  46.9 
 
 		 347 aa  268  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  41.27 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2553  extracellular solute-binding protein  43.25 
 
 		 372 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000043545  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  42.68 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  42.95 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  41.82 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  42.04 
 
 		 334 aa  263  4.999999999999999e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  40.32 
 
 		 334 aa  262  6e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  42.81 
 
 		 347 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  43.25 
 
 		 352 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0440  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  42.55 
 
 		 350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.576038  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  40.56 
 
 		 366 aa  258  7e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  39.81 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  44.21 
 
 		 347 aa  256  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 		 339 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  38.73 
 
 		 334 aa  252  6e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  43.04 
 
 		 349 aa  252  6e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  40.69 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  40.69 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  39.3 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  41.96 
 
 		 346 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  44.91 
 
 		 349 aa  249  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  44.91 
 
 		 347 aa  249  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  40 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 351 aa  246  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  39.43 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  38.28 
 
 		 374 aa  239  4e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  37.61 
 
 		 374 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  39.08 
 
 		 349 aa  236  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  37.5 
 
 		 333 aa  235  7e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  37.58 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  39.68 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  38.44 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  39.74 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  38.7 
 
 		 339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  38.75 
 
 		 333 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  38.44 
 
 		 333 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  39.06 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  39.68 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  39.06 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  39.94 
 
 		 338 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  38.12 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  40.13 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  37.07 
 
 		 333 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  37.79 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  37.27 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  39.35 
 
 		 335 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.46 
 
 		 336 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  39.3 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  41.4 
 
 		 338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  38.12 
 
 		 333 aa  225  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  36.61 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  39.87 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  36.5 
 
 		 372 aa  223  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  38.92 
 
 		 380 aa  220  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  38.61 
 
 		 338 aa  219  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  39.5 
 
 		 362 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  38.71 
 
 		 339 aa  218  7.999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  37.37 
 
 		 336 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  38.98 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  38.91 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  39.49 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  37.7 
 
 		 338 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  37.19 
 
 		 347 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1012  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  38.61 
 
 		 335 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676586  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  38.59 
 
 		 337 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  37.62 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  38.8 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  37.81 
 
 		 347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  36.11 
 
 		 348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  37.19 
 
 		 347 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  37.19 
 
 		 347 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  37.19 
 
 		 347 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  37.19 
 
 		 347 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4447  extracellular solute-binding protein  37.03 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  38.91 
 
 		 335 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  38.39 
 
 		 335 aa  209  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  36.88 
 
 		 347 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0543  extracellular solute-binding protein family 1  35.62 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>