More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5196 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  100 
 
 		 333 aa  689    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  98.5 
 
 		 333 aa  681    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  96.4 
 
 		 333 aa  650    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  99.7 
 
 		 333 aa  688    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  85.03 
 
 		 334 aa  593  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  85.44 
 
 		 332 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  84.54 
 
 		 333 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  84.18 
 
 		 332 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  83.28 
 
 		 333 aa  560  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  79.68 
 
 		 334 aa  533  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  60.44 
 
 		 337 aa  431  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  58.48 
 
 		 349 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  58.65 
 
 		 326 aa  393  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  54.4 
 
 		 374 aa  375  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  54.4 
 
 		 374 aa  373  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  53.72 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  55.02 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  53.5 
 
 		 372 aa  371  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  51.81 
 
 		 335 aa  359  5e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  44.58 
 
 		 345 aa  298  8e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  44.06 
 
 		 355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  39.7 
 
 		 347 aa  278  8e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  42.69 
 
 		 349 aa  278  9e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  43.63 
 
 		 345 aa  272  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  43.66 
 
 		 349 aa  262  6.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  42.72 
 
 		 353 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  40.54 
 
 		 340 aa  255  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  39.38 
 
 		 341 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  41.72 
 
 		 350 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  41.14 
 
 		 365 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  41.14 
 
 		 365 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  40.31 
 
 		 338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  38.34 
 
 		 355 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  39.24 
 
 		 351 aa  252  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  41.4 
 
 		 350 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  40.94 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  41.88 
 
 		 336 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  37.58 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  38.97 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  37.91 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  40.31 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  40.12 
 
 		 346 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  39.87 
 
 		 336 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  39.34 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.56 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  37.16 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  38.67 
 
 		 347 aa  241  1e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  40.99 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  36.06 
 
 		 335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  38.55 
 
 		 341 aa  239  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  39.12 
 
 		 337 aa  238  9e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  38.28 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  36.06 
 
 		 335 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  36.67 
 
 		 335 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  36.06 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  37.76 
 
 		 352 aa  236  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  36.67 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  36.17 
 
 		 335 aa  235  7e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  36.5 
 
 		 335 aa  235  9e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  38.76 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  36.06 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  36.5 
 
 		 339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  39.06 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  38.35 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  38.08 
 
 		 347 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 335 aa  229  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  37.61 
 
 		 347 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  35.95 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  36.61 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  38.75 
 
 		 348 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1012  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  36.34 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676586  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  35.95 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  37.57 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  38.12 
 
 		 347 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  38.12 
 
 		 347 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  37.13 
 
 		 380 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  36.83 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 347 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  37.11 
 
 		 349 aa  222  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  37.15 
 
 		 347 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  36.47 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  37.58 
 
 		 347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  37.19 
 
 		 347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  35.76 
 
 		 348 aa  218  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  36.99 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  38.33 
 
 		 345 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  35.85 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  34.97 
 
 		 348 aa  215  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 		 347 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  35.33 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  35.81 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  37.38 
 
 		 347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0570  extracellular solute-binding protein  37.05 
 
 		 341 aa  212  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  36.76 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  35.4 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>