More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3508 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
353 aa  718    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  63.46 
 
 
349 aa  479  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  56.32 
 
 
365 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  56.32 
 
 
365 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  59.26 
 
 
350 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  59.26 
 
 
350 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  58.47 
 
 
366 aa  411  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  56.13 
 
 
348 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  53.46 
 
 
340 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  49.53 
 
 
341 aa  338  9e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  46.02 
 
 
347 aa  333  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  48.31 
 
 
355 aa  332  8e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  47.08 
 
 
355 aa  329  4e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  50.15 
 
 
337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  51.42 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  50.46 
 
 
351 aa  327  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  49.23 
 
 
341 aa  324  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  48.31 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  46.95 
 
 
347 aa  315  8e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  52.22 
 
 
345 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  45.96 
 
 
347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  49.85 
 
 
347 aa  309  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  43.93 
 
 
346 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2553  extracellular solute-binding protein  50.46 
 
 
372 aa  308  9e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000043545  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  47.4 
 
 
352 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  48.17 
 
 
347 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  44.64 
 
 
335 aa  305  7e-82  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  48.42 
 
 
345 aa  305  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  46.42 
 
 
348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  46.48 
 
 
352 aa  302  6.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  45.51 
 
 
351 aa  297  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  46.2 
 
 
349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  46.81 
 
 
349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  46.32 
 
 
339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  44.65 
 
 
335 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  45.54 
 
 
337 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  43.26 
 
 
341 aa  279  5e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  44.03 
 
 
336 aa  278  7e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  46.2 
 
 
347 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  44.17 
 
 
353 aa  278  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  42.77 
 
 
334 aa  277  2e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  40.62 
 
 
336 aa  276  3e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  44.79 
 
 
342 aa  276  5e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  40.67 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  43.83 
 
 
339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  45.25 
 
 
333 aa  273  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  41.32 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  41.64 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  41.25 
 
 
374 aa  268  7e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  41.84 
 
 
374 aa  268  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  44.62 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  41.32 
 
 
334 aa  266  4e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  41.76 
 
 
349 aa  266  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  41.05 
 
 
351 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0440  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  37.74 
 
 
350 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.576038  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.77 
 
 
336 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  42.72 
 
 
333 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  42.44 
 
 
336 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  42.72 
 
 
333 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  44.89 
 
 
335 aa  260  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  42.41 
 
 
333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  43.13 
 
 
334 aa  259  7e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  43.17 
 
 
332 aa  258  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  42.11 
 
 
333 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  44 
 
 
336 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  41.85 
 
 
346 aa  257  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  42.55 
 
 
332 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  41.36 
 
 
334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  40.45 
 
 
336 aa  252  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  42.31 
 
 
347 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  41.98 
 
 
333 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  42.45 
 
 
337 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  41.51 
 
 
338 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  43.03 
 
 
338 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  41.87 
 
 
362 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1578  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  39.54 
 
 
334 aa  243  3e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.49279  normal  0.0225547 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  41.05 
 
 
333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20451  hypothetical protein  39.68 
 
 
342 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  39.81 
 
 
380 aa  239  5.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  39.51 
 
 
338 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  41.82 
 
 
347 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  41.69 
 
 
338 aa  236  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  41.19 
 
 
347 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  40.88 
 
 
347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  40.25 
 
 
347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  40.88 
 
 
347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  39.74 
 
 
335 aa  233  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  40.25 
 
 
347 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  40.06 
 
 
347 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  41.12 
 
 
354 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  38.78 
 
 
339 aa  230  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  37.77 
 
 
337 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  40.13 
 
 
338 aa  225  8e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16181  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  35.13 
 
 
341 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2002  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  36.78 
 
 
332 aa  224  3e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  40.85 
 
 
345 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  36.71 
 
 
337 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  39.94 
 
 
351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0774  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  37.26 
 
 
341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.899979  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  36.08 
 
 
337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>