268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1093 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  95.97 
 
 		 347 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  95.68 
 
 		 347 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  95.39 
 
 		 347 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  95.1 
 
 		 347 aa  653    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 347 aa  701    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  98.56 
 
 		 347 aa  694    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  95.68 
 
 		 347 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  88.05 
 
 		 347 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  86.79 
 
 		 351 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  86.79 
 
 		 351 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1511  ABC transporter, substrate binding protein  86.79 
 
 		 351 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  86.79 
 
 		 351 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  86.79 
 
 		 351 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  86.48 
 
 		 351 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  86.48 
 
 		 351 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  78.68 
 
 		 354 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  69.77 
 
 		 348 aa  487  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  69.77 
 
 		 349 aa  480  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  63.77 
 
 		 338 aa  450  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  64.07 
 
 		 380 aa  450  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  64.18 
 
 		 338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  62.54 
 
 		 345 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  65.63 
 
 		 362 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  63.34 
 
 		 345 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6288  extracellular solute-binding protein  65.94 
 
 		 341 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0579  extracellular solute-binding protein family 1  65.45 
 
 		 341 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0570  extracellular solute-binding protein  64.85 
 
 		 341 aa  423  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4447  extracellular solute-binding protein  64.04 
 
 		 337 aa  421  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0543  extracellular solute-binding protein family 1  62.39 
 
 		 341 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  59.44 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  57.28 
 
 		 338 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  56.66 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  56.04 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  53.25 
 
 		 346 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  51.34 
 
 		 349 aa  360  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  48.24 
 
 		 337 aa  339  5e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  47.35 
 
 		 337 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  49.42 
 
 		 338 aa  331  1e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  48.25 
 
 		 335 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  48.24 
 
 		 337 aa  328  6e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  45.11 
 
 		 352 aa  323  3e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  46.88 
 
 		 335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  47.85 
 
 		 337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  46.59 
 
 		 335 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  46.59 
 
 		 335 aa  317  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  45.37 
 
 		 336 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  46.59 
 
 		 335 aa  315  8e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1012  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  49.07 
 
 		 335 aa  315  9e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676586  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  46.43 
 
 		 335 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  44.61 
 
 		 339 aa  312  4.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  46.75 
 
 		 335 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.88 
 
 		 336 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  45.51 
 
 		 335 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  46.56 
 
 		 336 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  45.27 
 
 		 335 aa  309  4e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  45.16 
 
 		 335 aa  309  5e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  45.85 
 
 		 347 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  45.21 
 
 		 335 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  44.91 
 
 		 335 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  43.15 
 
 		 335 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  43.86 
 
 		 335 aa  301  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  45 
 
 		 345 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  38.29 
 
 		 347 aa  256  5e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  41.37 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  42.51 
 
 		 350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  42.59 
 
 		 345 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  42.51 
 
 		 350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  37.71 
 
 		 346 aa  252  6e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  42.19 
 
 		 365 aa  251  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  42.19 
 
 		 365 aa  251  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  44.44 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  39.53 
 
 		 351 aa  249  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  41.36 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  40.86 
 
 		 349 aa  249  6e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  40.68 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 347 aa  246  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  44.28 
 
 		 347 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  39.56 
 
 		 341 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  41.56 
 
 		 374 aa  243  3e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  40.62 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  43.52 
 
 		 352 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  41.12 
 
 		 347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  42.55 
 
 		 348 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  39.66 
 
 		 351 aa  242  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  41.56 
 
 		 374 aa  242  7e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  36.86 
 
 		 334 aa  242  7.999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  36.56 
 
 		 334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  36.56 
 
 		 334 aa  239  5e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  42.38 
 
 		 347 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  43.2 
 
 		 366 aa  238  9e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  40.57 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  41.43 
 
 		 353 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  38.75 
 
 		 339 aa  236  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  41.77 
 
 		 349 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  40.53 
 
 		 349 aa  236  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  40.41 
 
 		 337 aa  235  8e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  41.72 
 
 		 352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  40.37 
 
 		 347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 333 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>