More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0440 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0440  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  100 
 
 		 350 aa  709    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.576038  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  49.14 
 
 		 355 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  44.62 
 
 		 336 aa  291  9e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  44.59 
 
 		 349 aa  291  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  44.27 
 
 		 334 aa  276  4e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  37.18 
 
 		 340 aa  269  7e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  37.74 
 
 		 353 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  44.65 
 
 		 341 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  37.91 
 
 		 365 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  37.91 
 
 		 365 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  42.55 
 
 		 335 aa  259  6e-68  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  39.81 
 
 		 337 aa  258  9e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  37.15 
 
 		 350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  37.15 
 
 		 350 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  36.21 
 
 		 366 aa  252  7e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  43.35 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  38.99 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  39.56 
 
 		 335 aa  251  2e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  38.32 
 
 		 337 aa  248  9e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  37.9 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  39.33 
 
 		 347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  39.81 
 
 		 337 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  42.68 
 
 		 346 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  40.68 
 
 		 336 aa  246  6e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  37.93 
 
 		 334 aa  242  7e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  38.24 
 
 		 334 aa  242  9e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  38.24 
 
 		 334 aa  239  4e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  38.98 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.66 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  37.65 
 
 		 348 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  35.76 
 
 		 355 aa  226  6e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  37.17 
 
 		 339 aa  223  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  37.36 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  35.13 
 
 		 345 aa  222  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 		 347 aa  223  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  37.38 
 
 		 336 aa  222  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  35.38 
 
 		 347 aa  222  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  36.98 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  38.05 
 
 		 335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  35.38 
 
 		 347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  39.94 
 
 		 338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  37.28 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  36.22 
 
 		 347 aa  219  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2002  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  37.06 
 
 		 332 aa  219  5e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  37.54 
 
 		 349 aa  219  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  36.98 
 
 		 335 aa  219  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  38 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  38 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  35.9 
 
 		 342 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  35.04 
 
 		 351 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  32.58 
 
 		 351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  36.69 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  36.11 
 
 		 352 aa  215  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  37.9 
 
 		 346 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2553  extracellular solute-binding protein  34.97 
 
 		 372 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000043545  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  37.14 
 
 		 337 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  34.67 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  37.94 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20451  hypothetical protein  35.17 
 
 		 342 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  36.57 
 
 		 337 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  37.94 
 
 		 335 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  37.62 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  38.59 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  37.97 
 
 		 335 aa  212  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  37.38 
 
 		 335 aa  210  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1578  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  35.46 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.49279  normal  0.0225547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  33.97 
 
 		 348 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  35.89 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  37.62 
 
 		 335 aa  210  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  36.11 
 
 		 352 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  35.89 
 
 		 349 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  34.31 
 
 		 353 aa  209  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  33.99 
 
 		 347 aa  209  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  35.78 
 
 		 334 aa  205  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  35.86 
 
 		 338 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 		 334 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  35.78 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  37.62 
 
 		 335 aa  202  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  32.7 
 
 		 374 aa  202  9e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16181  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  33.65 
 
 		 341 aa  202  9e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  34.5 
 
 		 333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  36.58 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  36.14 
 
 		 337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  35.46 
 
 		 332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0774  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  33.65 
 
 		 341 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.899979  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  33.71 
 
 		 349 aa  199  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  34.29 
 
 		 338 aa  199  7.999999999999999e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  35.26 
 
 		 333 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  34.19 
 
 		 333 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  35.33 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  33.55 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  35.78 
 
 		 338 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13311  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  33.24 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.327656  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12551  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  33.55 
 
 		 342 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.733876  hitchhiker  0.00360834 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1012  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  35 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>