295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4447 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4447  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 337 aa  682    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  65.77 
 
 		 338 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  64.89 
 
 		 338 aa  455  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  64.89 
 
 		 380 aa  454  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  64.67 
 
 		 345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0543  extracellular solute-binding protein family 1  65.88 
 
 		 341 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6288  extracellular solute-binding protein  63.2 
 
 		 341 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  65.26 
 
 		 345 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0579  extracellular solute-binding protein family 1  65.06 
 
 		 341 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  63.5 
 
 		 362 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0570  extracellular solute-binding protein  64.46 
 
 		 341 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  61.38 
 
 		 348 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  64.69 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  64.78 
 
 		 351 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  64.78 
 
 		 351 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  63.12 
 
 		 347 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  64.47 
 
 		 351 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  64.78 
 
 		 351 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1511  ABC transporter, substrate binding protein  64.78 
 
 		 351 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  64.47 
 
 		 351 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  63.52 
 
 		 347 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  64.47 
 
 		 347 aa  421  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  63.52 
 
 		 347 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  63.52 
 
 		 347 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  63.84 
 
 		 347 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  63.52 
 
 		 347 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  64.78 
 
 		 351 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  61.78 
 
 		 349 aa  418  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  64.67 
 
 		 354 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  51.75 
 
 		 349 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  51.4 
 
 		 338 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  51.94 
 
 		 346 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  51.88 
 
 		 338 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  50.94 
 
 		 337 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  49.41 
 
 		 336 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  50.62 
 
 		 336 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  50.62 
 
 		 336 aa  339  5e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  50.62 
 
 		 336 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  49.55 
 
 		 352 aa  333  3e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  47.77 
 
 		 337 aa  328  8e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  47.77 
 
 		 337 aa  328  9e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  48.07 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  47.73 
 
 		 335 aa  319  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  46.39 
 
 		 335 aa  316  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  47.13 
 
 		 335 aa  315  9e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  45.1 
 
 		 339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  47.94 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  46.39 
 
 		 335 aa  309  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  46.53 
 
 		 335 aa  309  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  45.78 
 
 		 335 aa  309  5e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  46.22 
 
 		 335 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  46.53 
 
 		 335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  46.61 
 
 		 337 aa  306  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  46.22 
 
 		 335 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  45.79 
 
 		 335 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  43.92 
 
 		 335 aa  298  6e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1012  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  43.77 
 
 		 335 aa  296  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676586  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  41.84 
 
 		 335 aa  295  6e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  45.4 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  42.9 
 
 		 335 aa  290  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  43.61 
 
 		 335 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  44.2 
 
 		 345 aa  249  7e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  41.59 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  42.01 
 
 		 342 aa  245  6.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  40.6 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  41.4 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  38.99 
 
 		 334 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  42.09 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  37.2 
 
 		 351 aa  240  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  40.06 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  40.06 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  39.7 
 
 		 341 aa  239  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  40.88 
 
 		 339 aa  239  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  38.05 
 
 		 334 aa  239  5.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  41.69 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  40.36 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 		 347 aa  235  6e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  37.42 
 
 		 334 aa  235  7e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  38.86 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  43.56 
 
 		 347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  42.14 
 
 		 345 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  38.94 
 
 		 355 aa  230  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 347 aa  229  7e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  39.94 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  38.48 
 
 		 351 aa  226  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  41.27 
 
 		 352 aa  225  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  38.72 
 
 		 347 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  39.77 
 
 		 351 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  40.85 
 
 		 337 aa  222  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  38.56 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  37.96 
 
 		 335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  38.51 
 
 		 374 aa  217  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  38.2 
 
 		 374 aa  216  5e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  38.74 
 
 		 352 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  38.72 
 
 		 334 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  36.42 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  39.16 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  40.2 
 
 		 353 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  35.05 
 
 		 336 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  37.03 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>