294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2587 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
337 aa  694    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  69.97 
 
 
337 aa  475  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  66.47 
 
 
337 aa  463  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  60.5 
 
 
347 aa  414  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  56.29 
 
 
352 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  54.12 
 
 
351 aa  391  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  57.01 
 
 
352 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  53.16 
 
 
348 aa  381  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  52.87 
 
 
347 aa  383  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2553  extracellular solute-binding protein  55.28 
 
 
372 aa  368  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000043545  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  53.73 
 
 
347 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  53.56 
 
 
351 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  55.42 
 
 
347 aa  361  9e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  55.42 
 
 
349 aa  361  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  51.9 
 
 
350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  51.9 
 
 
350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  50.62 
 
 
349 aa  335  5.999999999999999e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  51.18 
 
 
341 aa  333  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  49.38 
 
 
341 aa  333  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  49.85 
 
 
336 aa  332  6e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  51.42 
 
 
353 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  50.47 
 
 
365 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  50.47 
 
 
365 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  48.06 
 
 
342 aa  322  6e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  49.53 
 
 
339 aa  315  9.999999999999999e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  49.84 
 
 
366 aa  311  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  45.97 
 
 
340 aa  301  7.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  44.01 
 
 
347 aa  291  9e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  45.79 
 
 
348 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  43.36 
 
 
347 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  40.65 
 
 
334 aa  279  4e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  45.08 
 
 
353 aa  279  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  40.83 
 
 
334 aa  278  1e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  47.34 
 
 
345 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  42.48 
 
 
346 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  40.83 
 
 
334 aa  277  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  43.57 
 
 
355 aa  276  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  43.81 
 
 
355 aa  276  5e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  40.47 
 
 
335 aa  275  9e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  44.97 
 
 
345 aa  272  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  42.18 
 
 
346 aa  271  1e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  44.65 
 
 
334 aa  269  4e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 
339 aa  262  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  41.54 
 
 
337 aa  261  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  41.96 
 
 
337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  41.92 
 
 
349 aa  259  7e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  42.68 
 
 
347 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  42.63 
 
 
347 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  42.63 
 
 
347 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  42.37 
 
 
347 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  42.63 
 
 
347 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  42.95 
 
 
347 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  41.4 
 
 
349 aa  256  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  40.48 
 
 
338 aa  255  8e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  40.48 
 
 
380 aa  255  9e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  42.63 
 
 
351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  42.63 
 
 
351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  41 
 
 
337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  42.01 
 
 
347 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  42.32 
 
 
351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  42.32 
 
 
351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  42.32 
 
 
351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  42.32 
 
 
351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1511  ABC transporter, substrate binding protein  42.32 
 
 
351 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  36.64 
 
 
351 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  41.46 
 
 
374 aa  251  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  39.3 
 
 
335 aa  250  2e-65  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  41.57 
 
 
338 aa  250  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  41.69 
 
 
347 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 
335 aa  249  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  40.63 
 
 
341 aa  249  5e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  43.36 
 
 
345 aa  248  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  41.46 
 
 
374 aa  248  1e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  42.11 
 
 
335 aa  246  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  40.95 
 
 
335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0440  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  39.81 
 
 
350 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.576038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  42.73 
 
 
345 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  44.48 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  41.32 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  39.94 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  41.01 
 
 
338 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  37.54 
 
 
336 aa  243  3e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  41.01 
 
 
338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  41.64 
 
 
336 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  41.05 
 
 
335 aa  242  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  40.32 
 
 
349 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  39.71 
 
 
335 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  38.51 
 
 
347 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  40.44 
 
 
354 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  39.71 
 
 
335 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6288  extracellular solute-binding protein  41.3 
 
 
341 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  40.62 
 
 
332 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  39.05 
 
 
337 aa  239  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1578  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  38.37 
 
 
334 aa  239  5e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.49279  normal  0.0225547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  39.76 
 
 
334 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  37.85 
 
 
336 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  40.18 
 
 
333 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  41.27 
 
 
362 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  38.05 
 
 
352 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  40.62 
 
 
332 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>