More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1188 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 335 aa  688    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  69.45 
 
 		 339 aa  461  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  57.96 
 
 		 349 aa  391  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  53.52 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  55.84 
 
 		 374 aa  381  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  55.52 
 
 		 374 aa  378  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  52 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  53.55 
 
 		 333 aa  359  3e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  53 
 
 		 332 aa  358  7e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  53 
 
 		 332 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  53.02 
 
 		 333 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  53.02 
 
 		 333 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  52.7 
 
 		 333 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  52.7 
 
 		 333 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  55.63 
 
 		 326 aa  353  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  54.19 
 
 		 334 aa  352  5e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  51.23 
 
 		 334 aa  347  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  51.78 
 
 		 333 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  50.16 
 
 		 333 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  46.75 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  47.52 
 
 		 345 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  43.49 
 
 		 351 aa  286  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  40.06 
 
 		 347 aa  277  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  47 
 
 		 345 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  43.4 
 
 		 350 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  43.4 
 
 		 350 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  40.76 
 
 		 349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  41.36 
 
 		 341 aa  263  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  39.66 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  39.66 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  42.28 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  40.88 
 
 		 347 aa  260  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  44.89 
 
 		 353 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  41.14 
 
 		 337 aa  258  8e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  40.06 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  39.52 
 
 		 341 aa  256  3e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  37.21 
 
 		 355 aa  256  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  38.74 
 
 		 349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  43.2 
 
 		 341 aa  252  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  39.34 
 
 		 335 aa  252  7e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  40.36 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  38.99 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  38.79 
 
 		 346 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  38.84 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  41.67 
 
 		 337 aa  249  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  38.74 
 
 		 335 aa  249  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  40.36 
 
 		 336 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  38.69 
 
 		 335 aa  248  7e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  40.66 
 
 		 340 aa  248  9e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  41.64 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  38.86 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  38.39 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  38.84 
 
 		 335 aa  246  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  38.39 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.32 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  38.1 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  38.1 
 
 		 335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  39.94 
 
 		 345 aa  242  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  38.3 
 
 		 337 aa  242  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  39.1 
 
 		 337 aa  241  9e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  37.13 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  39.59 
 
 		 345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  37.54 
 
 		 336 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  36.36 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  37.46 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  36.5 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  40.25 
 
 		 349 aa  237  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  38.14 
 
 		 338 aa  235  7e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  37.22 
 
 		 338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  41.01 
 
 		 353 aa  233  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  36.59 
 
 		 337 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  39.37 
 
 		 348 aa  231  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  37.58 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  38.94 
 
 		 347 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  36.94 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  35.74 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  37.94 
 
 		 348 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  38.1 
 
 		 338 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  38.32 
 
 		 351 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1012  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  35.93 
 
 		 335 aa  228  9e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676586  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  37.46 
 
 		 351 aa  228  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  38.32 
 
 		 351 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  37.64 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  38.32 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  38.32 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  38.32 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  38.32 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1511  ABC transporter, substrate binding protein  38.32 
 
 		 351 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  38.51 
 
 		 338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  38.87 
 
 		 342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  38.51 
 
 		 380 aa  225  7e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  38.2 
 
 		 354 aa  225  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  35.47 
 
 		 335 aa  225  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  36.81 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  37.8 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  39.87 
 
 		 339 aa  222  6e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6288  extracellular solute-binding protein  39.37 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  38.41 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>