More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0299 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 345 aa  706    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  62.38 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  53.04 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  51.15 
 
 		 351 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  54.55 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  55.38 
 
 		 341 aa  362  4e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  48.71 
 
 		 355 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  48.25 
 
 		 349 aa  353  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  46.96 
 
 		 365 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  46.96 
 
 		 365 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  47.45 
 
 		 340 aa  340  2e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  49.39 
 
 		 350 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  49.39 
 
 		 350 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  53.77 
 
 		 339 aa  332  4e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  49.85 
 
 		 337 aa  332  6e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  52.22 
 
 		 353 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  51.24 
 
 		 366 aa  325  7e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  48.26 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  48.57 
 
 		 346 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  48.9 
 
 		 348 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  45.81 
 
 		 349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  44.9 
 
 		 338 aa  311  1e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  45.95 
 
 		 336 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  47.48 
 
 		 374 aa  308  6.999999999999999e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  47.63 
 
 		 341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  47.3 
 
 		 334 aa  306  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  47.52 
 
 		 335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  45.65 
 
 		 346 aa  306  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  45.19 
 
 		 347 aa  306  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  44.41 
 
 		 337 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  43.95 
 
 		 335 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  44.25 
 
 		 335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  47.48 
 
 		 374 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  43.95 
 
 		 335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  43.95 
 
 		 335 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  46.47 
 
 		 338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  44.97 
 
 		 333 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  44.97 
 
 		 333 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  43.66 
 
 		 335 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  48.99 
 
 		 341 aa  302  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  43.95 
 
 		 335 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  45.51 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  45.02 
 
 		 333 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  41.79 
 
 		 339 aa  298  8e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  48.57 
 
 		 336 aa  298  8e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  44.9 
 
 		 335 aa  298  9e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  45.89 
 
 		 336 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  46.18 
 
 		 332 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  43.61 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  43.45 
 
 		 335 aa  297  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  46.18 
 
 		 332 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  45.89 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  43.07 
 
 		 335 aa  296  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  45.17 
 
 		 333 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  43.64 
 
 		 334 aa  296  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  44.51 
 
 		 337 aa  295  6e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  45.99 
 
 		 337 aa  295  7e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  45.51 
 
 		 349 aa  295  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  42.12 
 
 		 352 aa  293  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  46.03 
 
 		 333 aa  293  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  46.15 
 
 		 326 aa  292  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  43.22 
 
 		 372 aa  292  6e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  41.9 
 
 		 335 aa  291  8e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  45.19 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  41.12 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  44.79 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  46.98 
 
 		 353 aa  289  4e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  43.65 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  40.53 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  43.3 
 
 		 333 aa  285  8e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  44.44 
 
 		 338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  43.31 
 
 		 335 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  43.62 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  43.62 
 
 		 380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  43.31 
 
 		 335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  43.49 
 
 		 334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  44.74 
 
 		 338 aa  282  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  42.04 
 
 		 335 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  42.95 
 
 		 335 aa  280  2e-74  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  42.99 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  43.36 
 
 		 342 aa  278  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  45.94 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  40.85 
 
 		 334 aa  276  5e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  45.28 
 
 		 349 aa  276  5e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  41.64 
 
 		 336 aa  275  6e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  43.24 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  40.55 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  45.77 
 
 		 351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  45.91 
 
 		 347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  45.91 
 
 		 347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  45.77 
 
 		 351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  46.08 
 
 		 347 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  40.74 
 
 		 348 aa  272  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  45.77 
 
 		 351 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  45.77 
 
 		 351 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1511  ABC transporter, substrate binding protein  46.08 
 
 		 351 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  45.77 
 
 		 351 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  45.77 
 
 		 351 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  42.9 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  45.6 
 
 		 347 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>