178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00162 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00162  putative ABC-type transport system, periplasmic component  100 
 
 		 344 aa  696    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1876  extracellular solute-binding protein family 1  41.61 
 
 		 423 aa  261  1e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2277  extracellular solute-binding protein family 1  40.5 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0162  ABC-type iron(III) transport system,substrate-binding protein  38.68 
 
 		 385 aa  241  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  39.63 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1462  extracellular solute-binding protein family 1  31.68 
 
 		 392 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  36.77 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.252568 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  33.52 
 
 		 349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2720  extracellular solute-binding protein family 1  33.73 
 
 		 353 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.015536  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  34.08 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  34.94 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  31.95 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  34.88 
 
 		 345 aa  143  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  32.91 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  32.28 
 
 		 340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1923  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein 1  26.65 
 
 		 379 aa  136  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  31.55 
 
 		 347 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  31.09 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  32.06 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  30.82 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  27.6 
 
 		 335 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  27.36 
 
 		 335 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  29.14 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  27.49 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  30.79 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  27.49 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  27.81 
 
 		 338 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  26.3 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  28.94 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  28.81 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 340 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 338 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4671  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164274  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.37 
 
 		 329 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 358 aa  99.4  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 354 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5750  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177697  normal  0.666773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  28.98 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  25.4 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  28.69 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  26.81 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  27.6 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  30.77 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16181  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  26.82 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0774  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  27.03 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.899979  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  24.77 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  26.84 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12551  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  27.86 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.733876  hitchhiker  0.00360834 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  30.77 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  28.05 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13311  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  26.79 
 
 		 340 aa  65.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.327656  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1578  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  23.71 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.49279  normal  0.0225547 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  24.46 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13611  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  24.69 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2890  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  25.19 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>