More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1359 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 338 aa  689    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  97.34 
 
 		 338 aa  657    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  84.02 
 
 		 338 aa  582  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  81.66 
 
 		 338 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  77.81 
 
 		 338 aa  542  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  75.22 
 
 		 339 aa  528  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  75.52 
 
 		 339 aa  529  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  75.52 
 
 		 339 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  75.32 
 
 		 337 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  69.61 
 
 		 352 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  69.28 
 
 		 351 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  65.85 
 
 		 329 aa  450  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  63.69 
 
 		 338 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  61.11 
 
 		 340 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  57.45 
 
 		 341 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  60.19 
 
 		 342 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5750  extracellular solute-binding protein  57.73 
 
 		 341 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177697  normal  0.666773 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  60.19 
 
 		 342 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  60.19 
 
 		 342 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  52.28 
 
 		 354 aa  350  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  51.52 
 
 		 358 aa  348  6e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  50.8 
 
 		 343 aa  340  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  50.65 
 
 		 333 aa  334  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  42.16 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  40.88 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  38.18 
 
 		 347 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  38.87 
 
 		 335 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  38.87 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  37.99 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  35.84 
 
 		 337 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  35.84 
 
 		 337 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  34.94 
 
 		 337 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4671  extracellular solute-binding protein  34.49 
 
 		 337 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164274  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  35.03 
 
 		 355 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  34.91 
 
 		 342 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  34.74 
 
 		 349 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 		 340 aa  195  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  35.05 
 
 		 336 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  34.59 
 
 		 379 aa  193  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  34.29 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  30.52 
 
 		 372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  33.44 
 
 		 366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  33.02 
 
 		 363 aa  176  5e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2720  extracellular solute-binding protein family 1  32.02 
 
 		 353 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.015536  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  30.32 
 
 		 356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.252568 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  31.63 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  32.54 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  33.54 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  32.55 
 
 		 347 aa  149  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 355 aa  142  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  30.99 
 
 		 374 aa  139  7e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  32.12 
 
 		 365 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  32.12 
 
 		 365 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  29.45 
 
 		 349 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  28.88 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 350 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  27.33 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  26.51 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  25.85 
 
 		 333 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 335 aa  122  8e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20451  hypothetical protein  29.55 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 		 351 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  26.4 
 
 		 334 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 		 333 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0162  ABC-type iron(III) transport system,substrate-binding protein  27.65 
 
 		 385 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 		 381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  30.07 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  25.53 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 347 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2002  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  28.94 
 
 		 332 aa  116  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  27.87 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  30.54 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  28.47 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16181  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  28.83 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 353 aa  113  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  27.11 
 
 		 326 aa  112  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  26.65 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 337 aa  109  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  26.37 
 
 		 346 aa  109  5e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 355 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1578  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  28.23 
 
 		 334 aa  109  6e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.49279  normal  0.0225547 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 349 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  27.51 
 
 		 341 aa  108  9.000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0774  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  28.66 
 
 		 341 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.899979  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 345 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12551  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  26.98 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.733876  hitchhiker  0.00360834 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2890  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>