More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3650 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 343 aa  685    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  55.62 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  54.9 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  51.62 
 
 		 342 aa  359  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  51.62 
 
 		 342 aa  359  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  51.62 
 
 		 342 aa  359  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  51.34 
 
 		 340 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  50.59 
 
 		 338 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  50.46 
 
 		 339 aa  349  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  49.39 
 
 		 351 aa  349  4e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  50.15 
 
 		 339 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  50 
 
 		 338 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  51.62 
 
 		 338 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  50.45 
 
 		 338 aa  346  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  50.15 
 
 		 339 aa  345  4e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  49.69 
 
 		 338 aa  345  8e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  49.41 
 
 		 338 aa  344  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  50 
 
 		 352 aa  339  4e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  52.29 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  52.2 
 
 		 333 aa  333  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  46.59 
 
 		 341 aa  331  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5750  extracellular solute-binding protein  48.08 
 
 		 341 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177697  normal  0.666773 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  46.83 
 
 		 329 aa  327  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  40.06 
 
 		 348 aa  245  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  40.79 
 
 		 344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  41.75 
 
 		 372 aa  235  7e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  38.89 
 
 		 347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  38.97 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  39.48 
 
 		 343 aa  228  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  38.44 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  37.39 
 
 		 335 aa  222  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  41.16 
 
 		 379 aa  220  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  37.91 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  35.21 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  34.02 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  37.43 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  35.21 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  34.32 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  37.54 
 
 		 349 aa  209  8e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  37.9 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 		 336 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  37.14 
 
 		 363 aa  203  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4671  extracellular solute-binding protein  33.54 
 
 		 337 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164274  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  35.14 
 
 		 345 aa  192  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  36.66 
 
 		 356 aa  182  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.252568 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  33.63 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2720  extracellular solute-binding protein family 1  31.18 
 
 		 353 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.015536  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  32.99 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  31.46 
 
 		 346 aa  143  5e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  30.39 
 
 		 374 aa  138  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  30.17 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0162  ABC-type iron(III) transport system,substrate-binding protein  33.87 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  33.1 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  31.79 
 
 		 340 aa  135  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  31.19 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 374 aa  134  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  27.03 
 
 		 333 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  28.04 
 
 		 332 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  27.8 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 333 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  31.68 
 
 		 353 aa  129  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  32.03 
 
 		 335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  30.46 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  28.68 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 381 aa  126  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 372 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2002  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  28.66 
 
 		 332 aa  125  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 349 aa  125  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  30.35 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 333 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  31.68 
 
 		 335 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  30.92 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  32.5 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  32.5 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  26.67 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  30.59 
 
 		 337 aa  119  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  30.84 
 
 		 345 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20451  hypothetical protein  29.35 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  30.51 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1462  extracellular solute-binding protein family 1  29.32 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  31.27 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  28.52 
 
 		 350 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>