223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1462 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1462  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
392 aa  789    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0162  ABC-type iron(III) transport system,substrate-binding protein  42.67 
 
 
385 aa  278  8e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2277  extracellular solute-binding protein family 1  37.33 
 
 
397 aa  239  5.999999999999999e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  39.62 
 
 
372 aa  215  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1876  extracellular solute-binding protein family 1  39.34 
 
 
423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1923  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein 1  38.35 
 
 
379 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  34.19 
 
 
349 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00162  putative ABC-type transport system, periplasmic component  31.99 
 
 
344 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 
379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  31.61 
 
 
345 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  32.9 
 
 
340 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  31.95 
 
 
366 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2720  extracellular solute-binding protein family 1  30.36 
 
 
353 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.015536  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 
355 aa  146  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 
340 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  31.69 
 
 
356 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.252568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  28.39 
 
 
328 aa  137  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  31.56 
 
 
363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  28.88 
 
 
347 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  28.04 
 
 
343 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  27.53 
 
 
346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 
333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  30.57 
 
 
343 aa  115  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  27.53 
 
 
337 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 
337 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  28.06 
 
 
341 aa  113  5e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 
337 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  26.42 
 
 
344 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  28.34 
 
 
335 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  28.34 
 
 
335 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 
342 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 
342 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 
342 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 
335 aa  104  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
351 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 
346 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  26.39 
 
 
335 aa  100  4e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 
365 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 
348 aa  99.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 
365 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 
341 aa  98.6  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 
351 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4671  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 
337 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164274  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 
336 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 
352 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 
339 aa  92  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 
358 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5750  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
341 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177697  normal  0.666773 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 
336 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  25.46 
 
 
339 aa  89.7  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  25.46 
 
 
339 aa  89.4  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  26.84 
 
 
342 aa  89  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 
338 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 
347 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
354 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  23.74 
 
 
335 aa  87.8  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 
340 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  24.16 
 
 
329 aa  86.7  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
349 aa  86.7  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  25.52 
 
 
334 aa  86.3  8e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  25.17 
 
 
334 aa  86.3  9e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  25.17 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 
353 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  21.5 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  27.54 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  24.21 
 
 
334 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2002  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  23.81 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  23.79 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  21.2 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4447  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181234  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 
338 aa  79.7  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1578  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  24.21 
 
 
334 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.49279  normal  0.0225547 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 
349 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
335 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 
335 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>