189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1876 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1876  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 423 aa  855    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2277  extracellular solute-binding protein family 1  55.2 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0162  ABC-type iron(III) transport system,substrate-binding protein  43.96 
 
 		 385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00162  putative ABC-type transport system, periplasmic component  41.61 
 
 		 344 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1462  extracellular solute-binding protein family 1  36.86 
 
 		 392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  40.58 
 
 		 372 aa  209  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  38.77 
 
 		 340 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  37.12 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1923  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein 1  33.33 
 
 		 379 aa  180  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  34.5 
 
 		 379 aa  179  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  35.99 
 
 		 363 aa  168  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  33.2 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  36.54 
 
 		 366 aa  159  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  32.68 
 
 		 355 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  32.42 
 
 		 356 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.252568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2720  extracellular solute-binding protein family 1  32.45 
 
 		 353 aa  157  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.015536  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  34.73 
 
 		 342 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  30.48 
 
 		 328 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  28.96 
 
 		 337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 336 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 		 382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  28.95 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  28.62 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  29.73 
 
 		 335 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  29.73 
 
 		 335 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  27.63 
 
 		 343 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 381 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4671  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 337 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164274  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 339 aa  106  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.05 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  26.64 
 
 		 339 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  26.32 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 		 341 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 		 343 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 338 aa  97.8  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  28.26 
 
 		 338 aa  97.4  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 		 338 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 358 aa  96.7  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5750  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 341 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177697  normal  0.666773 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 338 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 340 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2890  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  24.68 
 
 		 374 aa  91.3  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 		 338 aa  90.9  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 		 335 aa  90.9  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 354 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 374 aa  88.2  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  25.55 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  22.06 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  22.68 
 
 		 333 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  24.48 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  23.87 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  22.1 
 
 		 333 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  25.22 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  26.01 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  25.22 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  25.96 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  22.81 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  20.97 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2002  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  21 
 
 		 332 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12551  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  24.22 
 
 		 342 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.733876  hitchhiker  0.00360834 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.49 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1578  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  21.71 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.49279  normal  0.0225547 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  23.89 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  24.84 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  21.94 
 
 		 341 aa  67  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>