More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2002 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2002  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  100 
 
 		 332 aa  682    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1578  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  72.73 
 
 		 334 aa  511  1e-144  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.49279  normal  0.0225547 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20451  hypothetical protein  64.35 
 
 		 342 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0774  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  60.38 
 
 		 341 aa  424  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.899979  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16181  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  59.43 
 
 		 341 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12551  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  58.64 
 
 		 342 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.733876  hitchhiker  0.00360834 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13521  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  59.16 
 
 		 323 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13611  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  57.23 
 
 		 340 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13311  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  57.23 
 
 		 340 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.327656  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1261  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  58.2 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  41.27 
 
 		 340 aa  275  8e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  37.62 
 
 		 341 aa  251  9.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  40.95 
 
 		 349 aa  249  5e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  38.72 
 
 		 345 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  38.92 
 
 		 365 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  38.92 
 
 		 365 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 		 355 aa  235  7e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  37.78 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  36.59 
 
 		 350 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  38.05 
 
 		 341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  36.59 
 
 		 350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  36.99 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  36.16 
 
 		 348 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  36.51 
 
 		 374 aa  225  8e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  36.79 
 
 		 345 aa  225  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  36.19 
 
 		 374 aa  224  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  36.47 
 
 		 349 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  38.24 
 
 		 366 aa  225  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  36.39 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  36.78 
 
 		 353 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  37.27 
 
 		 372 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0440  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  37.06 
 
 		 350 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.576038  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  36.19 
 
 		 339 aa  215  8e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  36.23 
 
 		 342 aa  215  9e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  37.74 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 		 335 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  35.51 
 
 		 335 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  36.48 
 
 		 337 aa  212  7e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 		 347 aa  212  7.999999999999999e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  34.72 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  35.22 
 
 		 351 aa  207  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  36.05 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  34.78 
 
 		 348 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  35.02 
 
 		 332 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  36.25 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  36.28 
 
 		 335 aa  206  5e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  34.7 
 
 		 334 aa  205  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  35.02 
 
 		 332 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  34.73 
 
 		 337 aa  203  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  35.11 
 
 		 353 aa  203  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  35.29 
 
 		 347 aa  202  8e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  35.33 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  34.07 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  33.86 
 
 		 334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 		 351 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  34.18 
 
 		 336 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  38.41 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  35.02 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  35.56 
 
 		 334 aa  199  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  34.81 
 
 		 333 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  34.2 
 
 		 351 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  35.02 
 
 		 333 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 		 346 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  32.92 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  33.75 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  35.42 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  36.19 
 
 		 341 aa  196  5.000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  32.6 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  35.4 
 
 		 352 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  34.27 
 
 		 347 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  34.38 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  34.28 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  35.02 
 
 		 338 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2553  extracellular solute-binding protein  38.32 
 
 		 372 aa  192  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000043545  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  33.23 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  34.16 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  34.48 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  33.14 
 
 		 349 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  32.09 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  32.81 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  35.02 
 
 		 338 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 336 aa  185  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 		 336 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  34.82 
 
 		 337 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4447  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 		 337 aa  182  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.06 
 
 		 336 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  35.46 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 		 335 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  34.7 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  32.72 
 
 		 347 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 		 335 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  33.02 
 
 		 349 aa  179  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  33.76 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  33.02 
 
 		 347 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  31.53 
 
 		 348 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  32.48 
 
 		 362 aa  175  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  33.76 
 
 		 352 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  33.87 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.84257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>