282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0774 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_16181  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  97.65 
 
 		 341 aa  685    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0774  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  100 
 
 		 341 aa  700    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.899979  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12551  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  71.35 
 
 		 342 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.733876  hitchhiker  0.00360834 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13521  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  70.98 
 
 		 323 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13311  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  67.15 
 
 		 340 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.327656  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13611  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  65.98 
 
 		 340 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1261  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  65.98 
 
 		 343 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20451  hypothetical protein  67.66 
 
 		 342 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2002  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  60.38 
 
 		 332 aa  424  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1578  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  57.86 
 
 		 334 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.49279  normal  0.0225547 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  42.18 
 
 		 340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  39.47 
 
 		 366 aa  239  4e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  36.83 
 
 		 341 aa  239  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  36.68 
 
 		 350 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  38.41 
 
 		 365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  38.41 
 
 		 365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  36.68 
 
 		 350 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  37.5 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  38.36 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  36.75 
 
 		 349 aa  227  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  36.63 
 
 		 347 aa  225  9e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  37 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  37.62 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  34.93 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  37.26 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  35.84 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  37.27 
 
 		 337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  36.34 
 
 		 348 aa  219  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  35.51 
 
 		 374 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  36.73 
 
 		 347 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  35.33 
 
 		 345 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  37.65 
 
 		 337 aa  213  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 		 347 aa  212  7e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  34.58 
 
 		 374 aa  210  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  35.8 
 
 		 346 aa  210  4e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  34.2 
 
 		 352 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  34.53 
 
 		 335 aa  209  6e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  34.97 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  35.19 
 
 		 346 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  32.07 
 
 		 339 aa  206  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 		 341 aa  206  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  35.38 
 
 		 352 aa  206  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  35.69 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  35.42 
 
 		 347 aa  205  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  35.62 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  32.24 
 
 		 342 aa  202  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2553  extracellular solute-binding protein  36.53 
 
 		 372 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000043545  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  34.27 
 
 		 339 aa  202  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  33.82 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  35.55 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  33.53 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0440  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.65 
 
 		 350 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.576038  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  35.62 
 
 		 353 aa  199  6e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  32.27 
 
 		 335 aa  198  9e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  36.53 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  32.56 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  33.95 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  34.78 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  31.88 
 
 		 337 aa  195  9e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  34.49 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  34.24 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  33.12 
 
 		 335 aa  192  6e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  31.8 
 
 		 334 aa  192  8e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  34.8 
 
 		 347 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 		 349 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  33.86 
 
 		 332 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  35.47 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  35.11 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  33.54 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  35.8 
 
 		 347 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  31.19 
 
 		 334 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  32.95 
 
 		 352 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  34.8 
 
 		 347 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  32.94 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  34.48 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  34.8 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  34.68 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  33.43 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  33.44 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  34.52 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  34.67 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  33.86 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  34.59 
 
 		 335 aa  186  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  33.85 
 
 		 347 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  30.89 
 
 		 334 aa  186  5e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  32.92 
 
 		 362 aa  186  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  34.17 
 
 		 347 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  34.17 
 
 		 347 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  34.17 
 
 		 347 aa  185  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  33.86 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  33.86 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  33.87 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  34.8 
 
 		 338 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  32.85 
 
 		 335 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  33.86 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  33.86 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  33.86 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  33.86 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>