More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0607 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 351 aa  709    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  86.4 
 
 		 352 aa  615  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  66.77 
 
 		 340 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  69.93 
 
 		 338 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  68.95 
 
 		 338 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  64.33 
 
 		 338 aa  455  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  65.66 
 
 		 342 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  65.66 
 
 		 342 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  65.66 
 
 		 342 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  69.61 
 
 		 338 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  63.82 
 
 		 338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  67.62 
 
 		 329 aa  450  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  61.54 
 
 		 338 aa  441  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  68.63 
 
 		 337 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  60.29 
 
 		 341 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5750  extracellular solute-binding protein  63.09 
 
 		 341 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177697  normal  0.666773 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  60.8 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  60.8 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  60.8 
 
 		 339 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  53.08 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  51.59 
 
 		 358 aa  358  8e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  51.63 
 
 		 343 aa  348  7e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  51.28 
 
 		 333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  40 
 
 		 347 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  41.18 
 
 		 344 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  40.58 
 
 		 343 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  41.92 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  39.71 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  41.08 
 
 		 335 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  37.22 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  37.22 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  37.22 
 
 		 337 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  35.99 
 
 		 355 aa  219  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4671  extracellular solute-binding protein  36.93 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164274  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  38.32 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  34.57 
 
 		 349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  35.84 
 
 		 340 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  34.1 
 
 		 342 aa  205  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  37.34 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 		 372 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  34.4 
 
 		 340 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  35.14 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  36.53 
 
 		 345 aa  182  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  33.87 
 
 		 328 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  33.55 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  33.52 
 
 		 340 aa  164  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  32.79 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.252568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  30.2 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  30.2 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2720  extracellular solute-binding protein family 1  30.72 
 
 		 353 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.015536  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  31.68 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  31.11 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  30.79 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 		 355 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 		 381 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  30.03 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0162  ABC-type iron(III) transport system,substrate-binding protein  29.57 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  29.83 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  30.12 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 		 374 aa  133  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  29.37 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 349 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  28.93 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  28.37 
 
 		 333 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  29.27 
 
 		 332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 		 336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  28.98 
 
 		 348 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  28.47 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  30.27 
 
 		 334 aa  125  8.000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 333 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 351 aa  125  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0440  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.86 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.576038  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  29.56 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 355 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  30 
 
 		 341 aa  122  6e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  25.08 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  28.18 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  30.69 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2002  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  29.52 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 		 347 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  28.08 
 
 		 346 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 337 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  29.43 
 
 		 334 aa  119  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 		 372 aa  119  9e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  29.06 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1578  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  29.77 
 
 		 334 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.49279  normal  0.0225547 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  27.53 
 
 		 333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  29.32 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>