More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3093 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 340 aa  678    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  82.3 
 
 		 342 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  66.13 
 
 		 366 aa  411  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  46.92 
 
 		 340 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  47.73 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  47.08 
 
 		 372 aa  295  7e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  50.16 
 
 		 379 aa  295  9e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  45.48 
 
 		 345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  43.18 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  44.8 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  38.11 
 
 		 356 aa  216  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.252568 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  36.04 
 
 		 354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  37.46 
 
 		 342 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  37.46 
 
 		 342 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  37.46 
 
 		 342 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  34.36 
 
 		 352 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  38.02 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  35.8 
 
 		 340 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  34.77 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  36.14 
 
 		 338 aa  202  7e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  34.46 
 
 		 339 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  34.46 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  35.15 
 
 		 351 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  35.21 
 
 		 338 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  33.43 
 
 		 358 aa  199  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  35.09 
 
 		 341 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  37.79 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  35.94 
 
 		 333 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  36.78 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2720  extracellular solute-binding protein family 1  34.94 
 
 		 353 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.015536  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  34.06 
 
 		 338 aa  195  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  34.19 
 
 		 338 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5750  extracellular solute-binding protein  35.4 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177697  normal  0.666773 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  35.58 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  35.4 
 
 		 348 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  36.28 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  34.02 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  34.68 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  35.28 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0162  ABC-type iron(III) transport system,substrate-binding protein  34.42 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  34.04 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  33.01 
 
 		 335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4671  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 		 337 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164274  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  30.98 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  30.98 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  33 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  33.44 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2277  extracellular solute-binding protein family 1  30.91 
 
 		 397 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1876  extracellular solute-binding protein family 1  32.24 
 
 		 423 aa  159  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  33.44 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  32.35 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  32.07 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2890  extracellular solute-binding protein family 1  30.89 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  31.72 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  35.9 
 
 		 339 aa  153  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  28.45 
 
 		 374 aa  150  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  31.72 
 
 		 333 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  34.11 
 
 		 349 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  31.25 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 		 349 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 372 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 355 aa  146  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  33.11 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  33.22 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  33.11 
 
 		 350 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  33.03 
 
 		 340 aa  145  9e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1462  extracellular solute-binding protein family 1  30.25 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  31.91 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 		 336 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  30.48 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  33.86 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  31.56 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  30 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  33.33 
 
 		 326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  31.12 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  31.19 
 
 		 347 aa  139  1e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  32.65 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  32.65 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  32.67 
 
 		 333 aa  137  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 348 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  32.7 
 
 		 337 aa  135  7.000000000000001e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  35.19 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00162  putative ABC-type transport system, periplasmic component  30.77 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  35.38 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 346 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1923  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein 1  28.4 
 
 		 379 aa  133  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  32.13 
 
 		 335 aa  132  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 336 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  32.47 
 
 		 338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>