More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2890 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2890  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
360 aa  732    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  31.46 
 
 
381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 
382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 
340 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  30.9 
 
 
355 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 
342 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  31.1 
 
 
366 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  29.63 
 
 
340 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  29.28 
 
 
329 aa  133  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 
372 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  28.48 
 
 
349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 
338 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 
335 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  30.04 
 
 
363 aa  127  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  26.25 
 
 
326 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  29 
 
 
349 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 
339 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
339 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  26.52 
 
 
332 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  30.99 
 
 
338 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  29.86 
 
 
335 aa  123  6e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 
333 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  27.49 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  30.74 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  26.53 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  26.53 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 
372 aa  120  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 
333 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 
345 aa  119  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  29.47 
 
 
341 aa  119  7.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
347 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  25.3 
 
 
332 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 
338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 
333 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 
354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  26 
 
 
337 aa  116  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
333 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  26.41 
 
 
374 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 
347 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 
337 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 
351 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  25.9 
 
 
333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 
349 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 
333 aa  113  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 
347 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 
338 aa  112  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  28.57 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  28.57 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  29.78 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 
328 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 
347 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  31.56 
 
 
345 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 
347 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  25.65 
 
 
335 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 
333 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 
347 aa  108  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
336 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  25.67 
 
 
347 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  26.54 
 
 
343 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 
362 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 
337 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
335 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5750  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 
341 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177697  normal  0.666773 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 
341 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 
347 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 
354 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 
346 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 
347 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 
338 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 
335 aa  107  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4447  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 
337 aa  107  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181234  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 
355 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  24.21 
 
 
344 aa  106  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  24 
 
 
335 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 
342 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 
342 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  25.7 
 
 
346 aa  105  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 
342 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  28.2 
 
 
335 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  27.97 
 
 
335 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  25.94 
 
 
334 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
335 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 
341 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 
347 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 
335 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 
335 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  25.67 
 
 
347 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 
335 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 
351 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 
349 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  32.23 
 
 
365 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>