More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3950 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 344 aa  695    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  74.26 
 
 		 347 aa  508  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  77.35 
 
 		 343 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  43.99 
 
 		 354 aa  278  9e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  45.13 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  45.09 
 
 		 348 aa  275  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  42.52 
 
 		 342 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  42.52 
 
 		 342 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  42.52 
 
 		 342 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  42.55 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  44.64 
 
 		 335 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  41.42 
 
 		 337 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  41.42 
 
 		 337 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  44.05 
 
 		 335 aa  262  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  41.42 
 
 		 337 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  42.25 
 
 		 339 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  42.25 
 
 		 339 aa  260  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  41.39 
 
 		 341 aa  259  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  44.82 
 
 		 336 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  44.09 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  41.98 
 
 		 358 aa  255  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  42.3 
 
 		 338 aa  255  9e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5750  extracellular solute-binding protein  41.88 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177697  normal  0.666773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4671  extracellular solute-binding protein  41.54 
 
 		 337 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164274  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  40.98 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  41.59 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  41.23 
 
 		 352 aa  247  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  40.66 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  41.23 
 
 		 351 aa  245  6.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  41.56 
 
 		 338 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  41.8 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  39.87 
 
 		 338 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  39.29 
 
 		 329 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  37.61 
 
 		 340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  38.83 
 
 		 379 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  35.69 
 
 		 355 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  35.37 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  35.61 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  36.23 
 
 		 340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  37.3 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  35.05 
 
 		 372 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  36.5 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  33.93 
 
 		 345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  33.87 
 
 		 340 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  34.92 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.252568 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  34.73 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2720  extracellular solute-binding protein family 1  33.05 
 
 		 353 aa  162  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.015536  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  31.78 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  32.81 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  32.81 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  32.65 
 
 		 349 aa  146  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 		 337 aa  145  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  29.19 
 
 		 374 aa  143  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 		 350 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  31.51 
 
 		 333 aa  139  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 		 350 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 		 339 aa  139  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 		 347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  31.25 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  30.36 
 
 		 341 aa  137  4e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  31.41 
 
 		 380 aa  136  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  31.41 
 
 		 338 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  31.1 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  27.97 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  28.53 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  29.41 
 
 		 352 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 355 aa  133  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 372 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  26.43 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0162  ABC-type iron(III) transport system,substrate-binding protein  30.97 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  28.11 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 333 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 		 349 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  28.32 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  26.43 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  27.73 
 
 		 337 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 382 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  26.98 
 
 		 332 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  29.39 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  34.57 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  30.74 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.11 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  34.57 
 
 		 351 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  34.57 
 
 		 351 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  34.57 
 
 		 351 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  34.57 
 
 		 351 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  34.57 
 
 		 351 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  34.57 
 
 		 351 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  31.82 
 
 		 345 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20451  hypothetical protein  30.41 
 
 		 342 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>