257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2015 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 328 aa  661    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2720  extracellular solute-binding protein family 1  58.24 
 
 		 353 aa  385  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.015536  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  41.35 
 
 		 372 aa  235  7e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  40.72 
 
 		 379 aa  229  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  43.37 
 
 		 349 aa  229  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 		 355 aa  206  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  40.88 
 
 		 356 aa  202  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.252568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  37.42 
 
 		 342 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  37.14 
 
 		 363 aa  199  5e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  36.86 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  36.83 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  33.93 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  33.66 
 
 		 337 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  34.04 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  33.66 
 
 		 337 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  33.66 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  36.45 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  34.19 
 
 		 352 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  33.87 
 
 		 351 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  36.25 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  33.23 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  32.62 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  34.38 
 
 		 347 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  32.93 
 
 		 335 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  33.04 
 
 		 338 aa  176  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  32.45 
 
 		 338 aa  175  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  32.62 
 
 		 339 aa  175  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  35.16 
 
 		 342 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  35.16 
 
 		 342 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  32.62 
 
 		 339 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  35.16 
 
 		 342 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4671  extracellular solute-binding protein  32.37 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164274  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  33.55 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  35.03 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  34.6 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5750  extracellular solute-binding protein  34.08 
 
 		 341 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177697  normal  0.666773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  34.19 
 
 		 337 aa  172  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  36.62 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  31.85 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  31.63 
 
 		 338 aa  162  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0162  ABC-type iron(III) transport system,substrate-binding protein  34.73 
 
 		 385 aa  161  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  31.93 
 
 		 329 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  34.29 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  31.35 
 
 		 338 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  32.74 
 
 		 354 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  30.43 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  34.18 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  31.55 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  31.55 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2277  extracellular solute-binding protein family 1  32.69 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  32.78 
 
 		 349 aa  142  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00162  putative ABC-type transport system, periplasmic component  32.91 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1462  extracellular solute-binding protein family 1  28.62 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 372 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1876  extracellular solute-binding protein family 1  30.48 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  29.62 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  33.22 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  29.1 
 
 		 350 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  27.81 
 
 		 333 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  29.8 
 
 		 348 aa  122  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  28.98 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  30.57 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  27.33 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  28.78 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  28.79 
 
 		 350 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  30.32 
 
 		 333 aa  119  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  31.46 
 
 		 345 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  28.74 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  29.08 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  31.21 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  26.71 
 
 		 332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  29.39 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 337 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  31.25 
 
 		 353 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  28.45 
 
 		 346 aa  112  7.000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  26.15 
 
 		 335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  25.16 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  31.21 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2890  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  32.2 
 
 		 354 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  26.05 
 
 		 340 aa  109  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>