More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8130 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  100 
 
 
340 aa  686    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  48.96 
 
 
372 aa  332  8e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  48.1 
 
 
355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  49.55 
 
 
342 aa  318  6e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  51.63 
 
 
366 aa  315  9e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  46.92 
 
 
340 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  50.32 
 
 
379 aa  298  7e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  44.54 
 
 
349 aa  286  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  49.68 
 
 
363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  45.73 
 
 
345 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  40.26 
 
 
356 aa  233  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.252568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2720  extracellular solute-binding protein family 1  37.68 
 
 
353 aa  216  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.015536  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  37.98 
 
 
348 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  34.52 
 
 
343 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  35.91 
 
 
333 aa  209  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  36.72 
 
 
342 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  36.72 
 
 
342 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  36.72 
 
 
342 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  36.79 
 
 
337 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  33.72 
 
 
338 aa  203  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 
339 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  32.35 
 
 
337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  33.04 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  32.35 
 
 
337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  34.53 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  32.93 
 
 
339 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  32.63 
 
 
339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  34.2 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  34.85 
 
 
336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  31.76 
 
 
337 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  32.66 
 
 
352 aa  195  8.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  33.43 
 
 
358 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  34.7 
 
 
351 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  34.29 
 
 
338 aa  192  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  34.08 
 
 
338 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  36.83 
 
 
328 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  33.43 
 
 
340 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5750  extracellular solute-binding protein  33.44 
 
 
341 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177697  normal  0.666773 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  34.29 
 
 
338 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  34.21 
 
 
354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4671  extracellular solute-binding protein  32.46 
 
 
337 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164274  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0162  ABC-type iron(III) transport system,substrate-binding protein  35.03 
 
 
385 aa  189  5e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1876  extracellular solute-binding protein family 1  38.77 
 
 
423 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  32.25 
 
 
341 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2277  extracellular solute-binding protein family 1  36.64 
 
 
397 aa  186  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  33.55 
 
 
343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  33.87 
 
 
347 aa  182  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  31.42 
 
 
329 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  33.88 
 
 
344 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  33.97 
 
 
381 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  33.44 
 
 
382 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1462  extracellular solute-binding protein family 1  32.9 
 
 
392 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 
374 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  29.91 
 
 
374 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2890  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 
360 aa  142  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 
372 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00162  putative ABC-type transport system, periplasmic component  32.28 
 
 
344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 
335 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  29.1 
 
 
333 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 
355 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 
347 aa  137  2e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 
333 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 
347 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 
333 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  26.93 
 
 
346 aa  137  4e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  31.95 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 
337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 
349 aa  132  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 
365 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 
365 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  28.74 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 
355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  31.42 
 
 
350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  28.76 
 
 
332 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1923  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein 1  28.44 
 
 
379 aa  129  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  31.08 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 
334 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 
337 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 
338 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 
339 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 
336 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  30.7 
 
 
336 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  28.75 
 
 
353 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 
339 aa  122  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  27.76 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  31.6 
 
 
340 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  28.16 
 
 
349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  28.87 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 
333 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  32.3 
 
 
348 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 
351 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  28.94 
 
 
338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  28.31 
 
 
326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  28.94 
 
 
380 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  26.67 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
335 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  29.77 
 
 
345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>