106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02405 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02405  periplasmic iron-binding protein  100 
 
 		 344 aa  686    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3357  extracellular solute-binding protein family 1  72.12 
 
 		 351 aa  468  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.825817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0288  periplasmic iron-binding protein  67.15 
 
 		 346 aa  456  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0259  extracellular solute-binding protein  66.28 
 
 		 346 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  45.62 
 
 		 368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  41.43 
 
 		 371 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  38.81 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.86 
 
 		 362 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.86 
 
 		 362 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  37.46 
 
 		 366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  37.76 
 
 		 366 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.76 
 
 		 362 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  37.16 
 
 		 366 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  37.16 
 
 		 366 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  37.16 
 
 		 366 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  37.16 
 
 		 366 aa  228  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  37.16 
 
 		 366 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.76 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  37.76 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  37.76 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  37.76 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0059  extracellular solute-binding protein  41.35 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4430  periplasmic iron-binding protein  38.05 
 
 		 350 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  38.14 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0059  extracellular solute-binding protein family 1  40.85 
 
 		 370 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  39.88 
 
 		 401 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  40.43 
 
 		 403 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  35.15 
 
 		 369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  35.8 
 
 		 365 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2272  hypothetical protein  40.06 
 
 		 381 aa  209  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2402  hypothetical protein  36.45 
 
 		 365 aa  209  8e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2764  extracellular solute-binding protein family 1  43.71 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247835  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  32.84 
 
 		 362 aa  207  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.84 
 
 		 354 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  32.54 
 
 		 362 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  39.81 
 
 		 380 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  33.43 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6109  ABC transporter substrate binding protein (iron)  34.49 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6139  extracellular solute-binding protein  40.95 
 
 		 354 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  33.95 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1449  extracellular solute-binding protein  37.84 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381136  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4161  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  33.65 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  39.2 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  33.64 
 
 		 368 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3338  putative iron ABC transporter, substrate-binding protein  34.08 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3493  extracellular solute-binding protein  38.08 
 
 		 358 aa  196  7e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685703  normal  0.0583739 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3637  extracellular solute-binding protein family 1  33.76 
 
 		 348 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4258  putative iron ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  32.91 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1804  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  34.49 
 
 		 354 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3126  putative periplasmic iron-binding protein  39.42 
 
 		 333 aa  194  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0309  periplasmic iron-binding protein  34.65 
 
 		 365 aa  189  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2735  putative iron(III) transport system substrate-binding protein  36.89 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0641317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0729  extracellular solute-binding protein  33.23 
 
 		 363 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.706674  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2265  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 380 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4733  putative periplasmic solute-binding protein  35.71 
 
 		 155 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  28.5 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 341 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  28.7 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.7 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.7 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.7 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  28.9 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1572  ABC transporter, substrate-binding protein  28.9 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1735  ABC transporter substrate-binding protein  28.9 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1786  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.9 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.93 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4658  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3241  phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC, putative  28.9 
 
 		 419 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.560629 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5871  extracellular solute-binding protein family 1  29.02 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1913  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0831866  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7093  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 432 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.069875  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0340  extracellular solute-binding protein  37.37 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.988078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1097  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3145  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.47265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2045  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 		 367 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.76929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2188  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 		 367 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2587  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  29.94 
 
 		 436 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2628  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  29.94 
 
 		 436 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2539  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  29.94 
 
 		 436 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4501  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 367 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1265  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11396  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4046  putative periplasmic solute-binding protein  23.95 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0699034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03855  periplasmic polyamine binding protein  30.77 
 
 		 353 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1926  extracellular solute-binding protein family 1  27.19 
 
 		 353 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4840  putative ABC transporter periplasmic binding component  27.83 
 
 		 340 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0305994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1762  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 340 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66245  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  22.59 
 
 		 382 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1459  extracellular solute-binding protein family 1  29.03 
 
 		 343 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0283759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3454  putative periplasmic solute-binding protein  26.09 
 
 		 337 aa  42.7  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357351  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0041  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 336 aa  42.7  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1418  extracellular solute-binding protein family 1  28.19 
 
 		 343 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.58033  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2736  extracellular solute-binding protein family 1  27.83 
 
 		 325 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1201  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 320 aa  42.7  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.523727 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1842  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 332 aa  42.7  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0219325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>