85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0259 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0288  periplasmic iron-binding protein  97.98 
 
 		 346 aa  683    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0259  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 346 aa  693    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02405  periplasmic iron-binding protein  66.28 
 
 		 344 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3357  extracellular solute-binding protein family 1  65.75 
 
 		 351 aa  424  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.825817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  42.47 
 
 		 368 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4430  periplasmic iron-binding protein  37.81 
 
 		 350 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.17 
 
 		 362 aa  225  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  40.24 
 
 		 371 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0059  extracellular solute-binding protein  42.37 
 
 		 377 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  36.31 
 
 		 362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.8 
 
 		 362 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.8 
 
 		 362 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0059  extracellular solute-binding protein family 1  40.06 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  35.22 
 
 		 366 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  35.22 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  34.63 
 
 		 366 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  34.63 
 
 		 366 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  36.01 
 
 		 362 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  34.8 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  35.22 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.8 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  34.8 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  34.8 
 
 		 362 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  34.63 
 
 		 366 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  34.63 
 
 		 366 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  38.08 
 
 		 401 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  40.26 
 
 		 403 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  38.94 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1804  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  36.19 
 
 		 354 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  38.61 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  35.35 
 
 		 365 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  32.54 
 
 		 369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  31.53 
 
 		 362 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  31.23 
 
 		 362 aa  196  6e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.68 
 
 		 354 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3493  extracellular solute-binding protein  39.74 
 
 		 358 aa  195  8.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685703  normal  0.0583739 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2272  hypothetical protein  37.06 
 
 		 381 aa  195  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6109  ABC transporter substrate binding protein (iron)  34.55 
 
 		 374 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6139  extracellular solute-binding protein  38.14 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  33.44 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2764  extracellular solute-binding protein family 1  39.93 
 
 		 362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247835  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  30.63 
 
 		 362 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  33.44 
 
 		 368 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4161  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  34.48 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2402  hypothetical protein  36.09 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3126  putative periplasmic iron-binding protein  42.75 
 
 		 333 aa  185  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3338  putative iron ABC transporter, substrate-binding protein  34.22 
 
 		 354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1449  extracellular solute-binding protein  35.4 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381136  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3637  extracellular solute-binding protein family 1  34.81 
 
 		 348 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4258  putative iron ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  32.57 
 
 		 366 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0309  periplasmic iron-binding protein  32.3 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2735  putative iron(III) transport system substrate-binding protein  35.18 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0641317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0729  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 		 363 aa  157  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.706674  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  27.73 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2265  extracellular solute-binding protein  21.79 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4733  putative periplasmic solute-binding protein  34.23 
 
 		 155 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  24.24 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.49 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.08 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1786  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.9 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.86 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.33 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1735  ABC transporter substrate-binding protein  24.9 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  24.9 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1572  ABC transporter, substrate-binding protein  24.9 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 338 aa  53.9  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 322 aa  50.1  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  22.74 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2833  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1990  putative regulatory lipoprotein  28.91 
 
 		 419 aa  47.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.307134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2481  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.37214  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.56 
 
 		 325 aa  43.9  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1078  extracellular solute-binding protein  32.61 
 
 		 322 aa  43.5  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2736  extracellular solute-binding protein family 1  27.19 
 
 		 325 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1463  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.512158  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03855  periplasmic polyamine binding protein  31.48 
 
 		 353 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 325 aa  42.7  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>