276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0951 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  99.72 
 
 
362 aa  742    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  99.72 
 
 
362 aa  742    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  99.72 
 
 
362 aa  742    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  84.17 
 
 
366 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  95.03 
 
 
362 aa  693    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  84.72 
 
 
366 aa  638    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  83.61 
 
 
366 aa  634    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  99.45 
 
 
362 aa  739    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  83.61 
 
 
366 aa  634    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  100 
 
 
362 aa  744    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  99.45 
 
 
362 aa  739    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  83.33 
 
 
366 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  82.79 
 
 
366 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  84.17 
 
 
366 aa  624  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  78.18 
 
 
362 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  78.24 
 
 
362 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  58.31 
 
 
369 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  60.18 
 
 
368 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  60.47 
 
 
368 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  60.06 
 
 
365 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  53.8 
 
 
362 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  52.38 
 
 
362 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  54.41 
 
 
354 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  52.66 
 
 
362 aa  381  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  45.88 
 
 
403 aa  330  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  44.89 
 
 
371 aa  325  9e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  46.53 
 
 
368 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  43.1 
 
 
401 aa  315  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  45.59 
 
 
380 aa  315  8e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  45.29 
 
 
380 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2402  hypothetical protein  42.51 
 
 
365 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6139  extracellular solute-binding protein  43.37 
 
 
354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160536  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2764  extracellular solute-binding protein family 1  43.22 
 
 
362 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247835  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4258  putative iron ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  40.13 
 
 
366 aa  258  9e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289237  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6109  ABC transporter substrate binding protein (iron)  35.69 
 
 
374 aa  252  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3637  extracellular solute-binding protein family 1  37.93 
 
 
348 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276394  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3338  putative iron ABC transporter, substrate-binding protein  37.93 
 
 
354 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0309  periplasmic iron-binding protein  36.13 
 
 
365 aa  242  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2272  hypothetical protein  39.56 
 
 
381 aa  236  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02405  periplasmic iron-binding protein  38.37 
 
 
344 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3357  extracellular solute-binding protein family 1  38.02 
 
 
351 aa  229  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.825817  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1449  extracellular solute-binding protein  37.03 
 
 
364 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381136  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0259  extracellular solute-binding protein  35.09 
 
 
346 aa  223  6e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4430  periplasmic iron-binding protein  35.78 
 
 
350 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0288  periplasmic iron-binding protein  34.88 
 
 
346 aa  218  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0729  extracellular solute-binding protein  34.77 
 
 
363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.706674  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0059  extracellular solute-binding protein family 1  35.78 
 
 
370 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4161  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  31.37 
 
 
369 aa  189  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648243  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0059  extracellular solute-binding protein  33.13 
 
 
377 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2735  putative iron(III) transport system substrate-binding protein  35.53 
 
 
303 aa  186  8e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0641317  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3126  putative periplasmic iron-binding protein  34.47 
 
 
333 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1804  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  31.56 
 
 
354 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3493  extracellular solute-binding protein  32.11 
 
 
358 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685703  normal  0.0583739 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2265  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 
380 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 
374 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  31 
 
 
364 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4733  putative periplasmic solute-binding protein  41.5 
 
 
155 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1842  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 
332 aa  89.7  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0219325  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 
338 aa  88.6  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  28.67 
 
 
333 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  28.17 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  25.4 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  27.82 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
343 aa  79.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.36 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.36 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0009  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.892782  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.96 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  25.08 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1735  ABC transporter substrate-binding protein  25.08 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1572  ABC transporter, substrate-binding protein  24.04 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1786  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.04 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 
350 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21960  hypothetical protein  27.03 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000202681 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.08 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1875  hypothetical protein  26.61 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 
378 aa  72  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  25.42 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.66 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1588  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 
368 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 
381 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 
341 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.66 
 
 
341 aa  63.9  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  24.01 
 
 
344 aa  63.9  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3418  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 
354 aa  63.2  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2833  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 
320 aa  62.8  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 
343 aa  63.2  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3993  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  25.99 
 
 
354 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.249752  normal  0.268451 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0641  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  22.44 
 
 
343 aa  62.8  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1726  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.76 
 
 
354 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477367  normal  0.0250834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1309  putative transporter  21.56 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>