214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1842 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1842  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 332 aa  669    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0219325  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1309  putative transporter  30.48 
 
 		 337 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442575  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  27.74 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 366 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 366 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.89 
 
 		 362 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.89 
 
 		 362 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  26.15 
 
 		 366 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 366 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 366 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  29.33 
 
 		 342 aa  90.5  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 366 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.11 
 
 		 338 aa  89.4  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 366 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 362 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.89 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  25.89 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  25.89 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  25.89 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.24 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.64 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.22 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.22 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.43 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  27.43 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.22 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  26.35 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  23.93 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1572  ABC transporter, substrate-binding protein  23.93 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1735  ABC transporter substrate-binding protein  23.93 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1786  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.93 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2940  twin-arginine translocation pathway signal  26.89 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4456  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00193533  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.41 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2736  extracellular solute-binding protein family 1  28.68 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1554  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.202841  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0009  extracellular solute-binding protein family 1  27.99 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.892782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1485  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0472403  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6021  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3791  ABC transporter, substrate-binding protein  28.97 
 
 		 344 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4941  ABC transporter substrate-binding protein  28.91 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  25.36 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1913  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0831866  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.8 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4956  ABC transporter substrate-binding protein  29.3 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.8 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5110  putative lipoprotein  28.91 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5501  putative lipoprotein  28.91 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5376  putative lipoprotein  29.3 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  29.04 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5350  putative lipoprotein  28.91 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5572  putative lipoprotein  29.69 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5382  putative lipoprotein  29.69 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2521  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1463  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.512158  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  25.35 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  25.65 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5052  putative lipoprotein  29.69 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1363  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.634696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5430  putative lipoprotein  28.91 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4453  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3418  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2481  extracellular solute-binding protein family 1  27.94 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.37214  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  23.94 
 
 		 401 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5367  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 342 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  24.23 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3135  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  26.64 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0223  hypothetical protein  23.85 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3495  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 375 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  0.246878 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2833  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  27.78 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0223  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.1 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>