229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1044 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 
362 aa  732    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  86.19 
 
 
362 aa  625  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  81.13 
 
 
366 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  81.13 
 
 
366 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  81.13 
 
 
366 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  81.13 
 
 
366 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  80.28 
 
 
366 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  80.28 
 
 
366 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  78.18 
 
 
362 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  78.18 
 
 
362 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  81.47 
 
 
366 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  78.45 
 
 
362 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  78.45 
 
 
362 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  78.73 
 
 
362 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  78.45 
 
 
362 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  78.18 
 
 
362 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  57.89 
 
 
369 aa  428  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  59.59 
 
 
365 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  59.82 
 
 
368 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  59.53 
 
 
368 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  56.27 
 
 
362 aa  404  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  55.99 
 
 
362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  56.82 
 
 
362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  57.06 
 
 
354 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  45.75 
 
 
403 aa  334  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  45.45 
 
 
380 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  45.16 
 
 
380 aa  319  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  46.22 
 
 
368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  43.59 
 
 
371 aa  312  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  41.78 
 
 
401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2402  hypothetical protein  42.51 
 
 
365 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6139  extracellular solute-binding protein  44.92 
 
 
354 aa  275  8e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160536  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2764  extracellular solute-binding protein family 1  41.55 
 
 
362 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247835  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4258  putative iron ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  40.13 
 
 
366 aa  255  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289237  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6109  ABC transporter substrate binding protein (iron)  36.59 
 
 
374 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0309  periplasmic iron-binding protein  37.81 
 
 
365 aa  245  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3637  extracellular solute-binding protein family 1  38.24 
 
 
348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276394  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3338  putative iron ABC transporter, substrate-binding protein  37.35 
 
 
354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2272  hypothetical protein  38.34 
 
 
381 aa  236  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02405  periplasmic iron-binding protein  38.81 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3357  extracellular solute-binding protein family 1  38.02 
 
 
351 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.825817  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0259  extracellular solute-binding protein  36.31 
 
 
346 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1449  extracellular solute-binding protein  35.31 
 
 
364 aa  220  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381136  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0288  periplasmic iron-binding protein  36.01 
 
 
346 aa  219  5e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0729  extracellular solute-binding protein  35.15 
 
 
363 aa  218  8.999999999999998e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.706674  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4430  periplasmic iron-binding protein  35.56 
 
 
350 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0059  extracellular solute-binding protein family 1  36.7 
 
 
370 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0059  extracellular solute-binding protein  33.74 
 
 
377 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2735  putative iron(III) transport system substrate-binding protein  35 
 
 
303 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0641317  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4161  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  31.06 
 
 
369 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648243  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1804  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  31.46 
 
 
354 aa  180  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3126  putative periplasmic iron-binding protein  34.38 
 
 
333 aa  172  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3493  extracellular solute-binding protein  33.03 
 
 
358 aa  159  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685703  normal  0.0583739 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2265  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 
380 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  32.2 
 
 
364 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4733  putative periplasmic solute-binding protein  39.74 
 
 
155 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 
374 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1842  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 
332 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0219325  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
338 aa  90.9  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  28.36 
 
 
333 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  28.84 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  26.39 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.39 
 
 
341 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.39 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.39 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  25.96 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.04 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1572  ABC transporter, substrate-binding protein  26.99 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 
326 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1786  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.99 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  26.99 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1735  ABC transporter substrate-binding protein  26.99 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0009  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.892782  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.72 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21960  hypothetical protein  28.52 
 
 
352 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000202681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1875  hypothetical protein  28.67 
 
 
352 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2833  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  25.53 
 
 
344 aa  67  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.01 
 
 
347 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  25.75 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0120  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 
340 aa  63.9  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 
381 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.89 
 
 
341 aa  62.8  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0641  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  23.73 
 
 
343 aa  63.2  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147653  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 
341 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3418  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 
354 aa  62.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1309  putative transporter  22.89 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442575  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 
343 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 
326 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.9 
 
 
341 aa  61.2  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>