80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0729 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0729  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
363 aa  733    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.706674  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1449  extracellular solute-binding protein  46.44 
 
 
364 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381136  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  43.38 
 
 
401 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  41.21 
 
 
371 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  41.38 
 
 
403 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  36.5 
 
 
366 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  35.89 
 
 
366 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  35.89 
 
 
366 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4258  putative iron ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  35.53 
 
 
366 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289237  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  36.2 
 
 
366 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  35.89 
 
 
366 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  35.58 
 
 
366 aa  225  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  34.27 
 
 
369 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2402  hypothetical protein  38.86 
 
 
365 aa  223  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6109  ABC transporter substrate binding protein (iron)  34.91 
 
 
374 aa  223  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  35.62 
 
 
366 aa  222  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  35.89 
 
 
362 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  35.15 
 
 
362 aa  219  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.97 
 
 
362 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.97 
 
 
362 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.97 
 
 
362 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3338  putative iron ABC transporter, substrate-binding protein  34.06 
 
 
354 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  34.66 
 
 
362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.66 
 
 
362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  40.13 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  34.66 
 
 
362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  39.81 
 
 
380 aa  212  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  34.46 
 
 
362 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3637  extracellular solute-binding protein family 1  34.06 
 
 
348 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276394  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  33.75 
 
 
365 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4430  periplasmic iron-binding protein  35.78 
 
 
350 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  33.44 
 
 
368 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0309  periplasmic iron-binding protein  36.17 
 
 
365 aa  205  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  33.44 
 
 
368 aa  206  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  34.08 
 
 
362 aa  205  9e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.08 
 
 
354 aa  205  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  33.76 
 
 
362 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 
362 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4161  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  32.38 
 
 
369 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648243  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  38.17 
 
 
368 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2272  hypothetical protein  37.69 
 
 
381 aa  190  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6139  extracellular solute-binding protein  36.19 
 
 
354 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160536  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3357  extracellular solute-binding protein family 1  35.09 
 
 
351 aa  170  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.825817  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0059  extracellular solute-binding protein family 1  33.14 
 
 
370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1804  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  33.88 
 
 
354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02405  periplasmic iron-binding protein  33.23 
 
 
344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2764  extracellular solute-binding protein family 1  39.77 
 
 
362 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247835  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0288  periplasmic iron-binding protein  32.59 
 
 
346 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0259  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 
346 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0059  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
377 aa  155  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2735  putative iron(III) transport system substrate-binding protein  31.17 
 
 
303 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0641317  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3493  extracellular solute-binding protein  31.79 
 
 
358 aa  129  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685703  normal  0.0583739 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3126  putative periplasmic iron-binding protein  29.84 
 
 
333 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4733  putative periplasmic solute-binding protein  34.23 
 
 
155 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2265  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  27.66 
 
 
364 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0223  hypothetical protein  21.82 
 
 
339 aa  52.8  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 
382 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0223  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.15 
 
 
339 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3791  ABC transporter, substrate-binding protein  22.56 
 
 
344 aa  47  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5110  putative lipoprotein  26.19 
 
 
344 aa  46.2  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5501  putative lipoprotein  26.19 
 
 
344 aa  46.2  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4941  ABC transporter substrate-binding protein  26.19 
 
 
344 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3418  extracellular solute-binding protein family 1  19.64 
 
 
354 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4956  ABC transporter substrate-binding protein  25.4 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5350  putative lipoprotein  26.19 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0924  extracellular solute-binding protein family 1  20.41 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 
325 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.69 
 
 
338 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5430  putative lipoprotein  25.4 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3159  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  24.57 
 
 
351 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451295  normal  0.0280644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 
326 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5376  putative lipoprotein  25.4 
 
 
344 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3542  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 
359 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2575  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 
363 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.941635  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3495  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 
375 aa  43.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  0.246878 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2195  periplasmic polyamine-binding protein, putative  29.84 
 
 
362 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.156454  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>