176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3159 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  735    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  38.83 
 
 		 374 aa  256  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2265  extracellular solute-binding protein  40.38 
 
 		 380 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  32.38 
 
 		 366 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  32.38 
 
 		 366 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  32.8 
 
 		 366 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  32.38 
 
 		 366 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  32.38 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  32.06 
 
 		 366 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  32.38 
 
 		 362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.57 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.57 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.57 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  30.57 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  30.57 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  30.57 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  31.04 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.25 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  30.31 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  34.08 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.87 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  29.07 
 
 		 368 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  29.07 
 
 		 368 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  28.75 
 
 		 365 aa  136  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  30.64 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6139  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 		 354 aa  112  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  29.63 
 
 		 371 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  28.99 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  29.7 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  28.92 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  28.62 
 
 		 380 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2402  hypothetical protein  28.02 
 
 		 365 aa  90.5  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2764  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 362 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247835  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4258  putative iron ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  23.13 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6109  ABC transporter substrate binding protein (iron)  23.57 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3338  putative iron ABC transporter, substrate-binding protein  22.99 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0259  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3637  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0288  periplasmic iron-binding protein  27.34 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1804  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  26.37 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0729  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.706674  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1449  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381136  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0309  periplasmic iron-binding protein  25 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0059  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02405  periplasmic iron-binding protein  28.5 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3357  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.825817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2833  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4430  periplasmic iron-binding protein  24.29 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4161  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  23.1 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648243  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.69 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0059  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 322 aa  67  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2272  hypothetical protein  25.65 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3126  putative periplasmic iron-binding protein  26.01 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21350  ABC-type Fe3+ transport system, substrate binding component  24.65 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2736  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1686  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.27 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0009  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.892782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 350 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0643  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  26.67 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121089  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2481  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.37214  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2993  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1275  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828972  normal  0.567692 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0120  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  26.1 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1318  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.801159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  26.15 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4649  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4733  putative periplasmic solute-binding protein  34.65 
 
 		 155 aa  57  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.93 
 
 		 347 aa  57  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.21 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3891  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  22.18 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1726  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.51 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477367  normal  0.0250834 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3878  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.33 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  24.04 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.04 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.21 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3993  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  26.51 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.249752  normal  0.268451 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1945  iron ABC transporter, iron-binding protein  24.11 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2485  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.390798  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1332  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  26.4 
 
 		 352 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0623244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.04 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 344 aa  54.7  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1366  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 344 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>