101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1804 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1804  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  100 
 
 
354 aa  733    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0059  extracellular solute-binding protein family 1  37.11 
 
 
370 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3493  extracellular solute-binding protein  41.01 
 
 
358 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685703  normal  0.0583739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0059  extracellular solute-binding protein  37.85 
 
 
377 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3357  extracellular solute-binding protein family 1  39.38 
 
 
351 aa  222  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.825817  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2735  putative iron(III) transport system substrate-binding protein  38.73 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0641317  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3126  putative periplasmic iron-binding protein  38.7 
 
 
333 aa  216  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4430  periplasmic iron-binding protein  37.81 
 
 
350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4161  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  35.37 
 
 
369 aa  203  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648243  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0259  extracellular solute-binding protein  36.19 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0288  periplasmic iron-binding protein  36.51 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  37.12 
 
 
371 aa  199  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  34.03 
 
 
368 aa  199  7.999999999999999e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02405  periplasmic iron-binding protein  34.49 
 
 
344 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  33.54 
 
 
401 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2272  hypothetical protein  34.27 
 
 
381 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6139  extracellular solute-binding protein  33.44 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160536  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1449  extracellular solute-binding protein  32.91 
 
 
364 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381136  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4258  putative iron ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  32.52 
 
 
366 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289237  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  31.46 
 
 
362 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2764  extracellular solute-binding protein family 1  34.98 
 
 
362 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247835  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6109  ABC transporter substrate binding protein (iron)  31.93 
 
 
374 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3637  extracellular solute-binding protein family 1  31.02 
 
 
348 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276394  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3338  putative iron ABC transporter, substrate-binding protein  31.9 
 
 
354 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 
362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  30.75 
 
 
362 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  32.11 
 
 
403 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 
366 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 
366 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 
369 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.19 
 
 
362 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.38 
 
 
354 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  31.25 
 
 
366 aa  170  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  30.39 
 
 
366 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  32.7 
 
 
362 aa  169  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 
366 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0309  periplasmic iron-binding protein  31.23 
 
 
365 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  30.39 
 
 
366 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 
366 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2402  hypothetical protein  29.38 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  32.72 
 
 
362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.56 
 
 
362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.56 
 
 
362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  31.5 
 
 
380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0729  extracellular solute-binding protein  33.88 
 
 
363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.706674  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  31.19 
 
 
380 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.56 
 
 
362 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  31.56 
 
 
362 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  31.56 
 
 
362 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  31.56 
 
 
362 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  30.94 
 
 
365 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  29.69 
 
 
368 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  29.69 
 
 
368 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2265  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 
380 aa  87  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  26.37 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4733  putative periplasmic solute-binding protein  27.15 
 
 
155 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 
382 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 
341 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 
362 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.33 
 
 
349 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.21 
 
 
341 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.05 
 
 
341 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.21 
 
 
341 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.05 
 
 
341 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  22.53 
 
 
341 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2829  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.71 
 
 
353 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0643  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  26.98 
 
 
346 aa  50.1  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121089  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1501  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 
348 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3071  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.02 
 
 
353 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1215  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.02 
 
 
353 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0399502  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0652  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.02 
 
 
353 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1412  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.02 
 
 
353 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0501  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.02 
 
 
353 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2074  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 
342 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1419  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.02 
 
 
353 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  28.93 
 
 
341 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1735  ABC transporter substrate-binding protein  28.93 
 
 
341 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 
322 aa  49.3  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1572  ABC transporter, substrate-binding protein  28.93 
 
 
341 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4354  putative ABC transport system, substrate-binding exported protein  21.97 
 
 
359 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1208  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 
342 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.527758  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1786  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.93 
 
 
341 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4343  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  25.31 
 
 
370 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1117  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 
361 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0753  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
365 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1234  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
365 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1116  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 
361 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1545  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 
339 aa  47  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.061269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.61 
 
 
844 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  30.53 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5341  ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein, putative  34.18 
 
 
367 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.169562  hitchhiker  0.0000795436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5250  extracellular solute-binding protein  34.18 
 
 
367 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2917  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 
339 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  26.4 
 
 
344 aa  43.9  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 
378 aa  43.9  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1913  extracellular solute-binding protein family 1  21.11 
 
 
348 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0831866  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5390  extracellular solute-binding protein  34.18 
 
 
367 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110702  normal  0.0735387 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>