258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1725 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  95.3 
 
 
362 aa  695    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  95.3 
 
 
362 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  84.72 
 
 
366 aa  636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 
362 aa  743    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  85.56 
 
 
366 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  84.43 
 
 
366 aa  637    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  95.03 
 
 
362 aa  713    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  95.03 
 
 
362 aa  693    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  84.15 
 
 
366 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  84.43 
 
 
366 aa  637    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  95.3 
 
 
362 aa  695    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  95.03 
 
 
362 aa  713    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  83.61 
 
 
366 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  85.28 
 
 
366 aa  628  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  78.73 
 
 
362 aa  591  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  79.12 
 
 
362 aa  577  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  60.82 
 
 
368 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  57.75 
 
 
369 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  60.53 
 
 
368 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  59.88 
 
 
365 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  54.37 
 
 
362 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  53.5 
 
 
362 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  53.22 
 
 
362 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  53.82 
 
 
354 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  44.74 
 
 
403 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  44.03 
 
 
371 aa  324  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  46.53 
 
 
368 aa  322  9.000000000000001e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  42.53 
 
 
401 aa  316  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  44.44 
 
 
380 aa  315  6e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  44.15 
 
 
380 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2402  hypothetical protein  42.55 
 
 
365 aa  278  7e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6139  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 
354 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160536  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4258  putative iron ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  39.81 
 
 
366 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289237  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2764  extracellular solute-binding protein family 1  42.37 
 
 
362 aa  255  8e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247835  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6109  ABC transporter substrate binding protein (iron)  36.88 
 
 
374 aa  249  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3637  extracellular solute-binding protein family 1  36.68 
 
 
348 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276394  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3338  putative iron ABC transporter, substrate-binding protein  36.99 
 
 
354 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0309  periplasmic iron-binding protein  35.57 
 
 
365 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02405  periplasmic iron-binding protein  38.37 
 
 
344 aa  237  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3357  extracellular solute-binding protein family 1  38.02 
 
 
351 aa  236  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.825817  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2272  hypothetical protein  38.39 
 
 
381 aa  232  7.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0259  extracellular solute-binding protein  35.47 
 
 
346 aa  229  5e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1449  extracellular solute-binding protein  36.25 
 
 
364 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381136  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0288  periplasmic iron-binding protein  35.17 
 
 
346 aa  225  7e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4430  periplasmic iron-binding protein  36.39 
 
 
350 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0729  extracellular solute-binding protein  35.28 
 
 
363 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.706674  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0059  extracellular solute-binding protein family 1  34.55 
 
 
370 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0059  extracellular solute-binding protein  33.44 
 
 
377 aa  192  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4161  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  32.3 
 
 
369 aa  192  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648243  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2735  putative iron(III) transport system substrate-binding protein  34.69 
 
 
303 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0641317  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1804  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  32.19 
 
 
354 aa  176  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3126  putative periplasmic iron-binding protein  33.23 
 
 
333 aa  172  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3493  extracellular solute-binding protein  32.42 
 
 
358 aa  164  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685703  normal  0.0583739 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2265  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 
380 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 
374 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  30.33 
 
 
364 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4733  putative periplasmic solute-binding protein  41.5 
 
 
155 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1842  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 
332 aa  89.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0219325  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 
338 aa  82  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  25.08 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.04 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0009  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.892782  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  27.46 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.04 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.72 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 
341 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  24.76 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1735  ABC transporter substrate-binding protein  24.76 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  26.73 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1572  ABC transporter, substrate-binding protein  23.72 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1786  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.72 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  27.34 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.76 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21960  hypothetical protein  26.1 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000202681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1875  hypothetical protein  25.55 
 
 
352 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 
344 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  26.19 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.8 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 
341 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 
342 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0641  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  23.36 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1588  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 
368 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.68 
 
 
347 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1554  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.202841  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3418  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 
354 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3878  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.97 
 
 
355 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1208  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 
342 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.527758  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1606  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.2 
 
 
355 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.273588 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2074  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 
342 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1117  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 
361 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>