More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2736 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2736  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 325 aa  648    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2481  extracellular solute-binding protein family 1  95.08 
 
 		 330 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.37214  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  74.84 
 
 		 326 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  62.26 
 
 		 322 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  56.29 
 
 		 325 aa  356  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0120  extracellular solute-binding protein  56.38 
 
 		 340 aa  341  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1463  extracellular solute-binding protein  50.61 
 
 		 326 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.512158  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  46.36 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1078  extracellular solute-binding protein  44.44 
 
 		 322 aa  256  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  32.93 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2833  extracellular solute-binding protein  34.44 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  34.63 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1201  extracellular solute-binding protein family 1  30.75 
 
 		 320 aa  152  7e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.523727 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  34.87 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  34.87 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  34.54 
 
 		 341 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  34.54 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  34.21 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  37.28 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1786  putative ABC transporter, substrate-binding protein  34.21 
 
 		 341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1572  ABC transporter, substrate-binding protein  34.21 
 
 		 341 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  34.21 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1735  ABC transporter substrate-binding protein  34.21 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0970  extracellular solute-binding protein  31.42 
 
 		 340 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000273849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  33.96 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  34.88 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3135  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  32.68 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5874  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6494  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  30.55 
 
 		 351 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000128013  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4607  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  31.1 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.980284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4473  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  31.1 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5135  ABC transporter, periplasmic binding protein  30.49 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.659918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0330  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  31.35 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.631264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5188  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  31.03 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3159  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  30.23 
 
 		 351 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451295  normal  0.0280644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5008  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2899  extracellular solute-binding protein  30.35 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00994055 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1237  extracellular metal-binding protein  31.23 
 
 		 358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1282  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  31.87 
 
 		 347 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1554  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 354 aa  119  6e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.202841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1476  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.23 
 
 		 358 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1235  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  31.23 
 
 		 358 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1212  iron ABC transporter solute-binding protein  31.23 
 
 		 358 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1214  iron ABC transporter solute-binding protein  31.23 
 
 		 358 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1337  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  31.23 
 
 		 358 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1411  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.23 
 
 		 358 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1436  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  31.23 
 
 		 346 aa  119  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3970  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.23 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1374  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.55 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3891  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5367  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5525  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655164  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1048  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 356 aa  113  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4694  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 349 aa  113  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.77 
 
 		 347 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  32.98 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5871  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  29.14 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.58 
 
 		 339 aa  106  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.001131  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 344 aa  105  8e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04877  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  30.74 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 343 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 350 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000766  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.03 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4801  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4658  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 		 440 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  30.24 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  30.85 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0811  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2746  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.77 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.553799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1273  putative periplasmic solute-binding protein  31.08 
 
 		 333 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384428  normal  0.646198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 382 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0643  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  29.97 
 
 		 346 aa  96.7  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121089  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2917  extracellular solute-binding protein family 1  27.19 
 
 		 339 aa  96.3  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1545  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.061269  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4456  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00193533  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  29.87 
 
 		 378 aa  93.6  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2485  extracellular solute-binding protein family 1  29.92 
 
 		 343 aa  93.2  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.390798  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1485  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 470 aa  92.8  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0472403  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0641  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  29.08 
 
 		 343 aa  90.5  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147653  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1097  extracellular solute-binding protein family 1  31.45 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.5 
 
 		 341 aa  90.1  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5854  hypothetical protein  31.45 
 
 		 335 aa  89.7  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.5 
 
 		 341 aa  89.4  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 342 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1588  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 368 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1366  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 344 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1791  solute-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.04 
 
 		 343 aa  86.7  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  0.0698003 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 342 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0923  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6061  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1663  extracellular solute-binding protein family 1  29.45 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0924  extracellular solute-binding protein family 1  28.03 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1772  extracellular solute-binding protein family 1  29.31 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.320595  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21350  ABC-type Fe3+ transport system, substrate binding component  22.88 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3454  putative periplasmic solute-binding protein  32.76 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357351  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1418  extracellular solute-binding protein family 1  29.69 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.58033  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.25 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>