224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3666 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  93.72 
 
 		 366 aa  688    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  95.9 
 
 		 366 aa  719    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  96.99 
 
 		 366 aa  725    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  99.45 
 
 		 366 aa  737    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  96.99 
 
 		 366 aa  723    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 366 aa  742    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  96.99 
 
 		 366 aa  723    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  83.33 
 
 		 362 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  83.33 
 
 		 362 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  84.15 
 
 		 362 aa  621  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  83.61 
 
 		 362 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  83.61 
 
 		 362 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  83.61 
 
 		 362 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  83.33 
 
 		 362 aa  617  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  80.28 
 
 		 362 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  79.71 
 
 		 362 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  61.4 
 
 		 368 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  58.38 
 
 		 369 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  61.11 
 
 		 368 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  58.55 
 
 		 365 aa  408  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  56.29 
 
 		 362 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  55.26 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  55.56 
 
 		 354 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  55.56 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  44.96 
 
 		 403 aa  334  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  43.3 
 
 		 401 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  43.87 
 
 		 371 aa  322  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  44.41 
 
 		 368 aa  317  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  43.75 
 
 		 380 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  43.48 
 
 		 380 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2402  hypothetical protein  43.48 
 
 		 365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6139  extracellular solute-binding protein  42.34 
 
 		 354 aa  276  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6109  ABC transporter substrate binding protein (iron)  36.94 
 
 		 374 aa  263  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4258  putative iron ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  40.13 
 
 		 366 aa  262  6.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2764  extracellular solute-binding protein family 1  41.78 
 
 		 362 aa  259  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247835  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3338  putative iron ABC transporter, substrate-binding protein  38.56 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3637  extracellular solute-binding protein family 1  37.93 
 
 		 348 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0309  periplasmic iron-binding protein  35.73 
 
 		 365 aa  246  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1449  extracellular solute-binding protein  37.81 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381136  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3357  extracellular solute-binding protein family 1  37.96 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.825817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2272  hypothetical protein  37.07 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02405  periplasmic iron-binding protein  37.16 
 
 		 344 aa  229  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0729  extracellular solute-binding protein  36.2 
 
 		 363 aa  225  8e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.706674  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0259  extracellular solute-binding protein  35.22 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0288  periplasmic iron-binding protein  34.03 
 
 		 346 aa  216  7e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4430  periplasmic iron-binding protein  35.78 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0059  extracellular solute-binding protein family 1  34.42 
 
 		 370 aa  199  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4161  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  31.99 
 
 		 369 aa  189  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0059  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 		 377 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2735  putative iron(III) transport system substrate-binding protein  34.38 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0641317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3126  putative periplasmic iron-binding protein  32.92 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1804  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  30.39 
 
 		 354 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3493  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 		 358 aa  169  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685703  normal  0.0583739 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 		 374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  31.33 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2265  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 380 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4733  putative periplasmic solute-binding protein  39.74 
 
 		 155 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1842  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 		 332 aa  93.2  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0219325  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 338 aa  89.7  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  27.82 
 
 		 364 aa  86.7  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  26.55 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  27.49 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1735  ABC transporter substrate-binding protein  27.49 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.16 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1572  ABC transporter, substrate-binding protein  27.14 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1786  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.14 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.16 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.81 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.09 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  25.89 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0009  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.892782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  25.23 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2833  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21960  hypothetical protein  25.81 
 
 		 352 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000202681 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1875  hypothetical protein  25.41 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.64 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0641  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  23.49 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147653  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1309  putative transporter  22.22 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442575  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0440  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.99 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.576038  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1588  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0120  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>