246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1309 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1309  putative transporter  100 
 
 		 337 aa  678    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442575  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4453  extracellular solute-binding protein  33.58 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1842  extracellular solute-binding protein family 1  30.48 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0219325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6021  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21350  ABC-type Fe3+ transport system, substrate binding component  27.05 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1554  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.202841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  27.78 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0643  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  26.35 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121089  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2736  extracellular solute-binding protein family 1  29.86 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.52 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1366  extracellular solute-binding protein family 1  27.38 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3970  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.06 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1436  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  28.06 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1411  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.06 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1235  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.06 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1212  iron ABC transporter solute-binding protein  28.06 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1214  iron ABC transporter solute-binding protein  28.06 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.19 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5874  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1337  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.06 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1476  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.06 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  22.19 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2940  twin-arginine translocation pathway signal  24.2 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  21.84 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1237  extracellular metal-binding protein  28.06 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5367  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.19 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  26.67 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1772  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.320595  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1463  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.512158  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4911  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1786  putative ABC transporter, substrate-binding protein  21.99 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1572  ABC transporter, substrate-binding protein  21.99 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0641  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  24.54 
 
 		 343 aa  69.3  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  21.99 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1735  ABC transporter substrate-binding protein  21.99 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0009  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.892782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1588  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1048  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5188  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  27.99 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5559  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.49 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0120  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2481  extracellular solute-binding protein family 1  28.77 
 
 		 330 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.37214  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1201  extracellular solute-binding protein family 1  29.13 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.523727 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1363  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.634696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.56 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.56 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2471  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  22.59 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  25.72 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1282  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  25.32 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5008  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0330  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  27.24 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.631264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5135  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.35 
 
 		 341 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.659918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2485  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.390798  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1762  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66245  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3418  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  22.89 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2631  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0644092  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1945  iron ABC transporter, iron-binding protein  28.17 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1078  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  24.58 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3495  extracellular solute-binding protein  30.95 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  0.246878 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4649  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.63 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.63 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2006  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4456  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00193533  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1097  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.27 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  25.27 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  21.27 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1485  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0472403  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3135  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  26.17 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  22.68 
 
 		 362 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2917  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  24.38 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  21.56 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>