236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1875 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1875  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  714    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21960  hypothetical protein  98.58 
 
 
352 aa  704    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000202681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1726  ABC transporter, periplasmic binding protein  78.19 
 
 
354 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477367  normal  0.0250834 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1318  extracellular solute-binding protein  77.75 
 
 
352 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.801159  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3993  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  77.9 
 
 
354 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.249752  normal  0.268451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4488  extracellular solute-binding protein  77.56 
 
 
353 aa  554  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.627866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1332  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  78.16 
 
 
352 aa  556  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0623244  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1275  extracellular solute-binding protein  76.62 
 
 
354 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828972  normal  0.567692 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0746  extracellular solute-binding protein family 1  74.43 
 
 
350 aa  545  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0725  extracellular solute-binding protein family 1  72.44 
 
 
350 aa  536  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1686  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  72.47 
 
 
354 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224605  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3878  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  72.27 
 
 
355 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1606  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  72.57 
 
 
355 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.273588 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000661  putative periplasmic solute-binding protein  66.57 
 
 
355 aa  490  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0827  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  66.67 
 
 
348 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  66.08 
 
 
348 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.860784  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1027  hypothetical protein  63.03 
 
 
355 aa  468  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1471  extracellular solute-binding protein family 1  62.61 
 
 
359 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3418  extracellular solute-binding protein family 1  38.66 
 
 
354 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2471  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 
390 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4228  extracellular solute-binding protein  37.4 
 
 
367 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0115  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.67 
 
 
367 aa  210  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512733  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0105  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.13 
 
 
367 aa  206  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2134  extracellular solute-binding protein  38.24 
 
 
364 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.575498  normal  0.605089 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2637  extracellular solute-binding protein family 1  38.35 
 
 
367 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142963  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2897  extracellular solute-binding protein family 1  37.76 
 
 
367 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1234  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  38.66 
 
 
414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0793  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  39.34 
 
 
410 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.295736  normal  0.158194 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1990  extracellular solute-binding protein  37.58 
 
 
366 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0514  extracellular solute-binding protein family 1  35.55 
 
 
371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.843064  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0346  ABC transporter, substrate binding protein  37.58 
 
 
366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0829  extracellular solute-binding protein  38.36 
 
 
368 aa  189  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0500  extracellular solute-binding protein  38.73 
 
 
367 aa  189  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0950  extracellular solute-binding protein  37.26 
 
 
366 aa  188  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0221  extracellular solute-binding protein  34.71 
 
 
365 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4201  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.68 
 
 
371 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0984  extracellular solute-binding protein  35.93 
 
 
366 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.366377  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2948  ABC transporter substrate binding protein  36.54 
 
 
366 aa  176  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2152  putative periplasmic solute-binding protein  34.85 
 
 
342 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.123138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7381  extracellular solute-binding protein  35.23 
 
 
387 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3326  Integrase catalytic region  35.47 
 
 
356 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.138399  normal  0.815514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1663  extracellular solute-binding protein family 1  33.86 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5854  hypothetical protein  34.12 
 
 
335 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4046  putative periplasmic solute-binding protein  34.12 
 
 
335 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0699034  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3454  putative periplasmic solute-binding protein  33.8 
 
 
337 aa  160  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357351  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1273  putative periplasmic solute-binding protein  33.45 
 
 
333 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384428  normal  0.646198 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4840  putative ABC transporter periplasmic binding component  31.75 
 
 
340 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0305994 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1265  extracellular solute-binding protein family 1  32.99 
 
 
337 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11396  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  33.67 
 
 
349 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  32.9 
 
 
362 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3124  extracellular solute-binding protein  33.57 
 
 
345 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5742  extracellular solute-binding protein  33.23 
 
 
383 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1418  extracellular solute-binding protein family 1  31.02 
 
 
343 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.58033  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4354  putative ABC transport system, substrate-binding exported protein  32.52 
 
 
359 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1380  ABC polyamine/opine/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  34.39 
 
 
382 aa  152  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1117  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
361 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1116  extracellular solute-binding protein  32.99 
 
 
361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1501  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 
348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1080  extracellular solute-binding protein  31.79 
 
 
377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0294396  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4695  extracellular solute-binding protein  32.86 
 
 
333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2074  extracellular solute-binding protein  32.32 
 
 
342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2829  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.65 
 
 
353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0486  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.22 
 
 
333 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.64062  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1208  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 
342 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.527758  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5127  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 
375 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5216  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 
375 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4343  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  32.06 
 
 
370 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5507  extracellular solute-binding protein  31 
 
 
375 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0753  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 
365 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1234  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 
365 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2082  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.86 
 
 
356 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.86 
 
 
356 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0354  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.86 
 
 
356 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2054  extracellular solute-binding protein  33.57 
 
 
378 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.4 
 
 
362 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.34313  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1786  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.4 
 
 
362 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0818  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.4 
 
 
362 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0448  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.4 
 
 
362 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1459  extracellular solute-binding protein family 1  31.36 
 
 
343 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0283759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1791  solute-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.36 
 
 
343 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  0.0698003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5734  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.49 
 
 
381 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.909966  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1419  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.69 
 
 
353 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0501  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.69 
 
 
353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3071  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.69 
 
 
353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1215  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.69 
 
 
353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0399502  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0652  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.69 
 
 
353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1412  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.69 
 
 
353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1913  extracellular solute-binding protein family 1  30.84 
 
 
348 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0831866  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.57 
 
 
844 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3312  putative periplasmic solute-binding protein  29.9 
 
 
339 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00706911  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4785  extracellular solute-binding protein  33.44 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5374  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.44 
 
 
362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0583866  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5486  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.44 
 
 
362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4569  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1111  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  30.7 
 
 
388 aa  136  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3334  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3029  extracellular solute-binding protein family 1  29.23 
 
 
360 aa  119  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.710769  normal  0.124039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8437  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 
349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2372  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 
396 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1108  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  58.33 
 
 
97 aa  96.3  8e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.719213  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3395  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 
381 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.441617  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>