69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0059 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0059  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 377 aa  732    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0059  extracellular solute-binding protein family 1  79.94 
 
 		 370 aa  544  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02405  periplasmic iron-binding protein  41.35 
 
 		 344 aa  229  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0259  extracellular solute-binding protein  42.68 
 
 		 346 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1804  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  38.15 
 
 		 354 aa  222  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0288  periplasmic iron-binding protein  42.37 
 
 		 346 aa  220  3e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3357  extracellular solute-binding protein family 1  40.42 
 
 		 351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.825817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4430  periplasmic iron-binding protein  35.94 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  41.93 
 
 		 368 aa  209  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  38.65 
 
 		 371 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  38.67 
 
 		 401 aa  209  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3493  extracellular solute-binding protein  41.01 
 
 		 358 aa  206  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685703  normal  0.0583739 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1449  extracellular solute-binding protein  37.6 
 
 		 364 aa  202  6e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381136  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2272  hypothetical protein  37.3 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0309  periplasmic iron-binding protein  37.35 
 
 		 365 aa  197  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  34.05 
 
 		 362 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4161  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  34.29 
 
 		 369 aa  195  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.44 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 		 366 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3126  putative periplasmic iron-binding protein  37.94 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 		 366 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.82 
 
 		 362 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.82 
 
 		 362 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  33.44 
 
 		 362 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 		 366 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2735  putative iron(III) transport system substrate-binding protein  35.6 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0641317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  32.51 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  32.21 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  32.21 
 
 		 366 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 		 366 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  35.2 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  33.13 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2402  hypothetical protein  34.39 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.13 
 
 		 362 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  33.13 
 
 		 362 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  33.13 
 
 		 362 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4258  putative iron ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  32.82 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  33.96 
 
 		 380 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  33.96 
 
 		 380 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3338  putative iron ABC transporter, substrate-binding protein  33.64 
 
 		 354 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  31.27 
 
 		 362 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 369 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.96 
 
 		 354 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  30.96 
 
 		 362 aa  176  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3637  extracellular solute-binding protein family 1  32.82 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6139  extracellular solute-binding protein  36.25 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6109  ABC transporter substrate binding protein (iron)  31 
 
 		 374 aa  173  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2764  extracellular solute-binding protein family 1  35.74 
 
 		 362 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247835  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  31.29 
 
 		 365 aa  169  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  30.67 
 
 		 368 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  30.37 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0729  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 363 aa  158  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.706674  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2265  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 380 aa  89.4  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  26.69 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4733  putative periplasmic solute-binding protein  30.72 
 
 		 155 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 374 aa  54.3  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 338 aa  53.9  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 382 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1078  extracellular solute-binding protein  21.9 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  24.03 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  24.03 
 
 		 335 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0386  periplasmic polyamine binding protein  33.33 
 
 		 353 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  25.42 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3009  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.274617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03855  periplasmic polyamine binding protein  33.33 
 
 		 353 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0041  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 336 aa  43.5  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>