More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1511 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1511  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 280 aa  565  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.683397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32060  transcriptional regulator of sugar metabolism  46.09 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134085  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8240  transcriptional regulator protein  43.17 
 
 		 261 aa  198  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.647989 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2486  transcriptional regulator, DeoR family  44.49 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.382458  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4074  transcriptional regulator, DeoR family  40.61 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.798271  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3114  DeoR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283003  hitchhiker  0.000123192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0882  transcriptional regulator, DeoR family  41.25 
 
 		 277 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.262564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2916  DeoR family transcriptional regulator  39 
 
 		 289 aa  158  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0804  DeoR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2151  DeoR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760268  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0857  DeoR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 273 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5318  transcriptional regulator, DeoR family  37.34 
 
 		 280 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13310  transcriptional regulator of sugar metabolism  40.25 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5327  transcriptional regulator, DeoR family  36.68 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.607169 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2907  DeoR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 262 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0868  DeoR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0815  DeoR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  33.77 
 
 		 260 aa  106  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3397  DeoR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3264  DeoR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  29.57 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  34.24 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4954  transcriptional regulator, DeoR family  30.68 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  33.75 
 
 		 267 aa  99  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  33.76 
 
 		 255 aa  95.5  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1144  DeoR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  33.77 
 
 		 252 aa  94  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  32.23 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  28.51 
 
 		 255 aa  93.2  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 255 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  32.05 
 
 		 254 aa  92.8  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 254 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  27.66 
 
 		 254 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.51 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  27.66 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  28.51 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  28.51 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4814  transcriptional regulator, DeoR family  32.75 
 
 		 261 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4756  transcriptional regulator, DeoR family  28.51 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.275318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  29.09 
 
 		 264 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  32.34 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0113  transcriptional regulator, DeoR family  29.91 
 
 		 253 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  29.6 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  26.69 
 
 		 258 aa  89.4  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0477  DeoR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 259 aa  89  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0119  transcriptional regulator, DeoR family  29.57 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2488  transcriptional regulator, DeoR family  32.88 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0242  transcriptional regulator, DeoR family  28.69 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4983  transcriptional regulator, DeoR family  28.51 
 
 		 289 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.947934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  34.2 
 
 		 267 aa  85.9  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4973  transcriptional regulator, DeoR family  27.62 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0890746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 258 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  30.94 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  30.62 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  30.05 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  30.2 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  32.93 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  31.01 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3258  DeoR family transcriptional regulator  25 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000943791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  25.38 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1675  DeoR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609311  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  32.03 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3321  DeoR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1687  DeoR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00757243  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8645  transcriptional regulator, DeoR family  32.5 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.846335 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2255  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2128  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  28.45 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  25.21 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2145  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  36.42 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0895  transcriptional regulator, DeoR family  32.46 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0542275 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02656  DNA-binding transcriptional activator  28.89 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0883  transcriptional regulator, DeoR family  28.89 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02617  hypothetical protein  28.89 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  25.51 
 
 		 257 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2946  DNA-binding transcriptional activator FucR  27.94 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000344425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3111  DNA-binding transcriptional activator FucR  28.89 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>