More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0351 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  100 
 
 
332 aa  660    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  89.87 
 
 
237 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  89.87 
 
 
237 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  89.87 
 
 
237 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  90.3 
 
 
237 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  89.87 
 
 
237 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  89.87 
 
 
237 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  88.61 
 
 
234 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  56.9 
 
 
232 aa  229  5e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  49.79 
 
 
233 aa  229  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  57.71 
 
 
234 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  55.98 
 
 
234 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  55.56 
 
 
234 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  55.13 
 
 
234 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  55.13 
 
 
234 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  57.71 
 
 
234 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  53.3 
 
 
234 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.51 
 
 
235 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.51 
 
 
235 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  53.56 
 
 
234 aa  205  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  52.79 
 
 
234 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  51.36 
 
 
227 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  52.63 
 
 
234 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  50 
 
 
235 aa  196  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  53.3 
 
 
234 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.79 
 
 
258 aa  192  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.55 
 
 
242 aa  192  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.86 
 
 
233 aa  188  9e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.66 
 
 
232 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  47.77 
 
 
256 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  48.46 
 
 
228 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  48.02 
 
 
228 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  48.02 
 
 
228 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  49.78 
 
 
231 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 
276 aa  169  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  47.95 
 
 
235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.79 
 
 
241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
245 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  38.53 
 
 
237 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.64 
 
 
247 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  48.42 
 
 
234 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  46.82 
 
 
241 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  41.78 
 
 
245 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  40.89 
 
 
243 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  45 
 
 
239 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
243 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.26 
 
 
237 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.26 
 
 
237 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  38.12 
 
 
265 aa  142  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  39.38 
 
 
244 aa  142  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 
237 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  37.67 
 
 
238 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
239 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  34.86 
 
 
243 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
237 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  37.44 
 
 
254 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  36.02 
 
 
304 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  37.89 
 
 
244 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  32.37 
 
 
274 aa  99.8  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
269 aa  95.9  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
278 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
238 aa  93.6  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 
270 aa  93.6  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.62 
 
 
271 aa  92.8  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  33.49 
 
 
286 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.67 
 
 
267 aa  90.5  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 
270 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
314 aa  90.5  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.33 
 
 
254 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
272 aa  90.1  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 
250 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 
290 aa  90.1  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  34.97 
 
 
270 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 
270 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  32.24 
 
 
284 aa  89.7  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
274 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
307 aa  89.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 
257 aa  89.4  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
274 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  30.08 
 
 
413 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.7 
 
 
271 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
300 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09378  conserved hypothetical protein  35.08 
 
 
282 aa  88.2  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.141306 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.83 
 
 
248 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  35.87 
 
 
272 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1018  short chain dehydrogenase  37.64 
 
 
298 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176999  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  27.19 
 
 
244 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 
275 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  37.43 
 
 
272 aa  87  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
268 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  31.72 
 
 
283 aa  86.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
270 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  33.13 
 
 
272 aa  86.7  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1223  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.2 
 
 
272 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 
227 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>